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302 中国科学 C 辑 生命科学 2006, 36 (4): 302~311
水稻杂种两优培9 与亲本苗期基因表达比较分析*
黄 毅 李利华 陈 莹 李香花 徐才国 王石平 张启发**
(华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 国家植物基因研究中心, 武汉 430070)
摘要 利用包含9198 条非重复cDNA 序列芯片研究了水稻两系杂交组合两优培9 及其亲本培
矮64s 和93-11 发芽后72 h 的幼苗和根中基因表达变化. 结果显示: 8587 条序列在3 个基因型的
幼苗和根中同时检测到表达信号; 1571 条(18.3%)序列在幼苗或根中 3 个基因型间检测到显著表
达差异(P0.01), 亦即表达多态性, 其中 121 条(1.4%)序列在幼苗和根中同时检测到表达多态性;
870 条(10.1%)序列在杂种与双亲或与亲本之一有显著表达差异. 基因功能预测分析表明: 多态性
表达序列的分布与基因功能有关, 碳水化合物、能量和脂类代谢以及逆境应答等功能类型出现多
态性表达基因的数量明显高于期望值, 而氨基酸代谢、转录翻译调节以及信号转导等功能类多态
性表达基因的数量明显低于期望值. 214 条(2.5%)序列在表达水平上存在显著杂种优势(P0.05),
其中117 条(54.7%)与已知基因存在同源性, 涉及基础代谢、遗传信息传递、细胞生长和死亡、信
号转导、物质转运和逆境应答等功能. 研究结果为理解基因表达多态性与性状表型变异的关系以
及水稻苗期发育和杂种优势的分子机制提供了有用信息.
关键词 水稻 幼苗 根 基因表达 基因芯片 杂种优势
水稻基因组测序计划完成以及各种技术平台的 种子发芽是植物一生的最初阶段, 研究杂种和
日臻完善加速了水稻功能基因组学的研究步伐, 对 亲本早期幼苗基因表达变化对认识幼苗生长发育调
水稻遗传变异、表型多样性以及杂种优势分子机制研 控和杂种优势形成机制有重要意义. 已有研究证实
究具有重要意义[1~3]. 杂种的基因来源于亲本, 基因 杂种与亲本之间存在基因表达差异. Xiong等人[5]和
变异可能引起基因表达差异, 最终导致表型差异, 杂 Sun等人[6]采用DDRT-PCR方法研究了水稻和小麦杂
种优势形成可能由基因差异表达调控引起[4] . 因此, 种与亲本间mRNA 表达丰度和表达模式差异, 发现
从表达水平研究杂种与亲本之间的基因表达差异, 基因表达模式与杂种优势存在相关性. Tian等人[7]发
对于揭示杂种优势的分子机制具有重要意义. 现玉米杂种优势与杂种中基因表达抑制有关. 由于实
收稿日期: 2005-12-10; 接受日期: 2006-03-17
* 国家重点基础研究专项计划(973)项目(批准号: 001CB1088)、国家自然科学基金项目(批准号:与国家功能基因组学和生物芯片重大
专项(批准号: 2002AA2Z1002)资助
** 联系人, E-mail: qifazh@
SCIENCE IN CHINA Ser. C Life Sciences
第 4 期
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