我国九省（市、区）82株嗜肺军团菌血清1型菌株的序列分型.pdf

．论著． 我国九省(市、区)82株嗜肺军团菌血清 1型菌株的序列分型 朱兵清任红宇周海健秦天邵祝军 【摘要】 目的了解我国环境水中嗜肺军团菌血清1型(印1)菌株的序列分型特征，并初步建 立我国军团菌序列分型数据库。方法 采用序列分型(SBT)方法，对我国9个省(市、自治区) 2005—2008年间环境水中分离的82株印1菌株进行分型，同时采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方 法对这些菌株进行分型，并采用BioNumerics5．1软件对2种方法的分型结果进行聚类分析和比较。 结果 82株印l菌株分为22种序列(ST)型，其中17种sT型是新序列型，新发现1个等位基因； ST·1型为主要的序列型，在8个省(市、自治区)均有发现，该型菌株占所有菌株的46．3％(38／82)； B6、s3和s8)发现2种以上sT型；通过聚类分析，15种sT型被分为3个序列群(ST-l序列群、ST-154 序列群和ST一149序列群)，其余7种sT型没有序列群归类。采用PFGE分型方法，这砦菌株町被分 为46种带犁。SBT和PFGE两种方法结合可将82株菌株分为54种分子犁别。两种方法的聚类分析 结果具有良好的一致性。结论 我国环境水中印l菌株具有独特的SBT分布；通过研究，初步建立 了我国军团菌序列分型数据库。 【关键词】 军团病杆菌，嗜肺；细菌分型技术； 电泳，凝胶，脉冲场 of82strainsof 1 isolatedfrom9 in Sequence-basedtyping serotypeLegioneUapneumophila provinces ChinaZHU Bing—qing，RENHong-yu。ZHOUHai-jian，Q／NTian．SHAOZhu-jun．StateKeyLaboratory DiseasePreventionand InstituteCommunicableDiseaseControland forInfectious Contr01．Nationalfor DiseaseControland Prevention，ChineseCenter加r Prevention。Be泖ng』D2206．China author：SHA0 cn Corresponding Zhu-jun。Email：shaozhujun@icda To the characteristicsof the 【Abstract】0bjectiveanalyze Sequence—based Typing(SBT)of l fromenvironmentalwaterin thencreatea SerotypeLegionellapneumoph池(印1)isolated China，and database．MethodsAtotalof82strainsof厶1isolatedfromenvironmentslwaterin9 preliminary provinces between2005 ofChina and2008were SBTmethodandPul8ed．fieldGel genotypedby Electrophoresis resultsofthetWOdifferentmethodswerethen cluster