DNA序列分析在植物分子系统学研究中的应用现状以蔷薇科为例.pdfVIP

园　艺 　学 　报 　2009, 36 ( 12) : 1827 - 1836 A cta Horticu lturae Sin ica D NA 序列分析在植物分子系统学研究中的应用现 状 ———以蔷薇科为例 郑小艳 , 曹家树 , 滕元文 (浙江大学园艺系 , 农业部园艺植物生长发育与品质调控重点开放实验室 , 杭州 3 10029) 摘 　要 : 近 20年来 , DNA 序列已被广泛应用于植物各分类阶元的系统学研究中 , 为解决长期有争议 的和亟待解决的系统进化问题提供了有力的证据 。现以蔷薇科为例 , 概述了应用 DNA 片段进行植物分子系 统研究的现状 , 详细剖析了应用 DNA 序列进行植物系统发育研究时常见的问题及其原因 , 提出了对存在多 倍化 、杂交起源和快速分化等复杂进化史的植物类群进行系统学分析时选用 DNA 序列的策略和注意事项 。 关键词 : 蔷薇科 ; DNA 序列 ; 系统发育 ; ITS假基因; 低拷贝核基因 中图分类号 : S 68512　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 0513353X (2009) 12 182710 Research Progress of Plan t M olecular Phy logenetic Ana ly ses Ba sed on D NA Sequence D a ta —A Ca se Rev iew in Rosaceae ZH EN G X iaoyan , CAO J iaShu , and TEN G Yuanwen (D ep a rtm en t of H orticu ltu re, the S ta te A g ricu ltu ra l M in is try Key L abora tory of H orticu ltu ra l P lan t Grow th, D evelopm en t and Q ua lity Imp rovem en t, Z hej iang Un ivers ity, H angzhou 3 10029, Ch ina) A b stract: Du ring the la st twen ty years, DNA sequence s have been w idely u sed in p hylogenetic analyse s of p lan ts at the differen t taxonom ic levels, and p rovided convincing evidence to so lve the longstand ing disp u ted or un so lved p hylogenetic p rob lem s. In th is p ap er, the cu rren t statu s of app lication s of DNA fragm en ts in p lan t p hylogenetic studie s were b riefly reviewed tak ing Ro saceae a s an examp le, and the common troub le s oc cu rring in p hylogenetic studie s and the po ssib le rea son s were d iscu ssed in detail. F inally, the strategie s and po in ts for atten tion in selecting DNA sequence s were p ropo sed for p hylogenetic recon struction of p lan t taxa e s p ecially for p lan ts that have u