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斑点杂交实验.doc
斑点杂交实验
探针的标记:
取DNA 2ug于20ul 水中,于沸水中煮沸变性10分钟,迅速放入冰中,5分钟。加入4ul prime混合物,37°C过夜,加0.5M EDTA 1ul终止反应,保存于-20°C冰箱中备用。
点膜:
样品DNA:50ng/dot 2ul/dot
阴性对照鱼精DNA:50ng/dot 2ul/dot(浓度5mg/ml 1:200稀释)
变性:1N NaOH 30分钟
中和:0.6M NaCl、1M Tris-HCl pH7.2 15分钟x1
3M NaCl\ 0.5MTris-HCl 15分钟x1
漂洗:2XSSC 迅速漂洗一次。将膜夹滤纸中,120°C烤30分钟。用保鲜膜包好,于4°C冰箱备用。
预杂交:
预杂交液
去离子甲酰胺 10ml
20xSSC 5ml
0.4M PB 1ml
50x denhardt’s 5ml
鱼精DNA(变性) 0.4ml(5mg/ml)
膜于杂交管中,加入预杂交液,于杂交仪中42°C 3-5小时。
杂交:
杂交液的配制:
标记好的探针DNA、鱼精DNA于100°C沸水中变性,置冰中10分钟待用。
去离子甲酰胺 10ml
20xSSC 5ml
0.4M PB 1ml
50x denhardt’s 0.4ml
鱼精DNA(变性) 0.4ml(5mg/ml)
双蒸水补 4ml
探针DNA(变性) 20ul
于42°C杂交过夜。
漂洗: 62°C
2×SSC--0.1% SDS 15’
0.1×SSC--0.1%SDS 15’
0.1×SSC 15’
(以下步骤于0.05M Tris.HCl-0.12M NaCl系统中,均在室温)
封闭:封闭液1ml (5% 脱脂奶粉 ) 0.5-1小时
漂洗:用0.05M Tris.HCl-0.12M NaCl 1ml 漂洗 1×10’
抗体:1ml 1-2小时 (1:3000-1:10000)
漂洗:用0.05M Tris.HCl-0.12M NaCl 漂洗 3(1ml)×10’
显色:药片一片,30ml蒸馏水中,显色3-5分钟。用水终止反应
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