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一个新的生物群体生长数学模型
一个新的生物群体生长数学模型1
1 1* 1 1 2 1 1
宋健 ,林建群 ,金燕 ,沈红 ,林慧彬 ,林建强 ,曲音波
1 山东大学微生物技术国家重点实验室,济南(250100)
2 山东省中医药研究院,济南(250014)
摘 要: 本文构建了一个描述限制性环境条件下生物群体生长规律的数学模型。模型中比生
长速率( μ)是时间(t )的函数。模型可以很好地拟合多种生物或生物细胞群体生长的延迟期、
指数期和稳定期。该模型参数少,模型参数生物学意义明确,计算简单。
关键词:数学模型;群体生长;比生长速率
1.前 言
生物群体生长数学模型在理论研究和生产实践上都具有重要的意义,在生态学、微生物
学与微生物工程学、传染病学和人口学等诸多领域都有着广泛的应用。在微生物工程学领域,
由于细胞生长与目的代谢产物生产相互关联,因此生物群体生长数学模型被广泛应用于微生
[1~6 ]
物发酵和动、植物细胞培养的过程预测、解析和过程控制 。
为了充分描述复杂环境因素对生物群体生长规律的影响,有的作者使用大量的限制性条
件和大量的模型参数以构建更复杂的广义生长模型[7] ,然而,复杂的广义生长模型因其参数
的增加而给模型的求解和试验设计带来很大的困难。另一方面,有的作者则使用多项式来拟
合实验数据。但是,多项式拟合方法其模型参数往往不具有明确的生物学意义。因此,上述
[8]
两种建模方法都很少被采用 。
目前,被广泛接受的描述生物群体在限制性条件下生长的数学模型是Monod 方程和
Logistic 方程。自然界里生物群体的生长受到环境条件(如营养、空间)的限制,生物群体
的生长速率在利用有限资源的过程中随着限制性条件或限制程度的变化而持续的变化,其生
长规律表现为“S 型”曲线[9] 。Monod 方程以限制性营养物浓度作为限制性因素,缺点是方
程不适用于培养的延迟期(lag phase )和稳定期(stationary phase )。Logistic 方程以一定环
境条件下所能达到的最大群体密度作为限制性因素,缺点是方程不适用于培养的延迟期[8,
10]
。
本文的目标是构建一个可以描述生物群体生长的延迟期、指数生长期(exponential
phase )和稳定期的群体生长模型,并且模型简单,参数少,参数的生物学意义明确,以便
于实际应用。
2 .建模原理
在限制性条件下群体生长的特点是培养初期生长受抑制或生长速度较慢,之后生长加
快,当比生长速率达到最大值之后会逐渐降低以至停止生长[11] ,即μ由小变大,再由大变
小,呈现一个“钟”形曲线[1] 。本文用方程(1)描述μ随时间的这种变化规律:
(t −t max )2
−
2
2⋅t
μ μ ×e L (1)
max
其中,μ 为最大比生长速率,t 为μ达到μ 的时间,t 为延迟期的时间。方程(1)
max max max L
1本课题得到高等学校博士学科点专向科研基金(20040422062 ),国家重点基础研究发展规划 973 项目
(2004CB619202 ,2003CB716006, 2004CB719702 ),山东省优秀青年科学家基金(03BS143 )资助。
*通讯作者E-mail :jianqunlin@
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