2007-2008年肠道病毒71型北京地区分离株的VP4基因序列分析.pdf

·16· 2007--2008年肠道病毒71型北京地区分离株 的VP4基因序列分析 李玉运1…，朱汝南2，钱渊2”，邓洁2，孙宇2，王芳2，赵林清1t2 1．北京协和医学院研究生院，北京100730；2．首都儿科研究所病毒研究室，北京100020 摘要：为了解2007—2008年北京地区流行的肠道病毒7l型(EV71)是否存在基因序列变异及其与病毒毒 力的关系，我们选择2007年分离的3株EV71(其中1株分离自重症手足口病患儿的咽拭子标本，其余2株分 离自普通手足口病患儿咽拭子标本)和2008年分离的5株EV71(其中3株分离自重症手足口病患儿的咽拭 子或鼻拭子标本，2株分离自普通手足口病患儿的疱疹液标本)，提取基因组RNA，经反转录一聚合酶链反应 VP4基 (RT-PCR)扩增得到VP4基因片段，并进行核苷酸序列测定，使用生物信息软件与GenBank中的EV71 因进行序列及病毒型别分析。结果表明，所测得的8株EV7lVP4基因全长均为207bp，编码69个氨基酸，理 VP4的核苷酸 他EV71病毒株VP4的核苷酸同源性为82％～100％，与阜阳、深圳和台湾等地区流行的EV71 同源性比其他地区高。除了与印度报道的VP4编码的氨基酸在第7和54位不同外(印度株：7位蛋氨酸，54 VP4 位苏氨酸；其余株7位苏氨酸，54位丙氨酸)，这8株EV71VP4编码的氨基酸序列之间以及与其他EV71 编码的氨基酸同源性均为100％。8株EV71病毒VP4与文献报道的3株重症感染病毒株VP4(BrCr、MS和 (BJ25、BJ47、BJ65和BJ67)分离到的毒株之间VP4基因序列未见明显改变，只有几个核苷酸存在差别。VP4 核苷酸序列的进化树分析表明，这8株EV71均属于C4亚型，显示2007—2008年北京地区流行的EV71的 VP4基凶相当保守，分离自伴有神经系统感染的重症手足口病和普通手足口病患儿的EV71的VP4基凶之间 在核苷酸水平未出现同样的变异。结果提示，近2年来北京地区所流行的EV71属C4亚型。 关键词：肠道病毒7l型；VP4基因；手足口病；北京 for VP4ofenterovirus71isolatedin Sequenceanalysis Beijingduring 2007to2008 LIYu．Yunl”，ZHU Yuan2”，DENGJie2，SUNYu2，WANG Lin— Ru．Nan2，QIAN Fan92，ZHAO Qin91’2 J．GraduateSchool UnionMedical ofPeking College，Beijing100730，China；2．LaboratoryofVirology，Capital Institute of 100020，China Pediatrics，Bering understandthe variation Abstract：To between ofenterovims7l(EV71)anditsvirulence。the relationship sequence oftheVP4 ofEV7l viruswas strainsofEV71 isolatedfromclinicsI collectedfrom gene analyzed．Ei曲t samples infantsandchildrenwithhand．footandmouthdiseaseintheChildren’s A陆liatedto Institut