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LCMSMS定量分析流程与经验
LC-MS/MS定量分析流程与经验
美国应用生物系统中国公司
应用技术服务部
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第一步:Q1 SCAN——确定母离子的质荷比
●根据待测化合物性质,选择分析的极性(+/ -)、离子化
方式(ESI/APCI),根据分子量选择扫描范围和时间
●确定母离子的质荷比,准确到小数点后一位。
参数设置:
扫描方式:Q1 Scan
质量范围:Parameter Range,100~MW+30,t=1~2sec
Center Width,MW±5Da,t=0.5sec
通过手动调节DP、GS1,使喷雾平稳、有效
2 Date | AB CONFIDENTIAL © 2006 Applied Biosystems
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第二步:Product Ion Scan —— 确定子离子的质荷比
●得到高质量的MS2图,母离子的强度为图谱中基峰强度
的1/3到1/4为宜
●平滑后选择子离子质荷比,确定到小数点后一位
参数设置
扫描方式:Product Ion Scan
质量范围:Parameter Range,50~MW+10,t=1~2sec
通过手动调节CE
3 Date | AB CONFIDENTIAL © 2006 Applied Biosystems
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第三步:优化化合物参数
●根据前面选出的母、子离子,组建MRM离子对
●选择多个离子对时,应合理分配每一对的分析时间
●用“Ramp”,优化Compound项下各参数,以及Source
项下CAD参数。各离子对应分别设定。
●初步建立MRM方法
●一般优化两次,以得到比较确切的结果
4 Date | AB CONFIDENTIAL © 2006 Applied Biosystems
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第四步:方法转化:将连续进样方法→LC-MS方法
● 关掉所有质谱分析界面,将现有质谱体系灭活,激活液相色谱、
质谱设备。
● 单击Acquire 中Build Acquire Method,打开上面保存过的MRM
方法,添加设备:色谱泵、自动进样器等。
● 设置色谱同步。
● 设置色谱参数,分析时间一般为0.6~1min,流动相组成和流量
与实际样品分析时相同;修改质谱分析时间,与色谱参数一致;
设置GS1、GS2、TEM初始值为40 、40 、400左右,保存方法,
例如:LC-MRM.dam。
5 Date | AB CONFIDENTIAL © 2006 Applied Biosystems
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第五步:FIA-优化Source参数
●将前面用过的样品溶液稀释100~1000倍。
● 在Tune项下,双击Quantitative Optimization,选择FIA分析,
根据向导进行自动优化。不接色谱柱进行FIA定量优化
● 注意:需要优化的各可选值之间用“;”分隔。
● 当对源参数含义及设置比较清楚后,可以省略此步。
6 Date | AB CONFIDENTIAL © 2006 Applied Biosystems
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第六步:色谱条件优化
●接好并平衡色谱柱,用适当浓度标准品考察分离情况
●根据色谱分离情况,会设定梯度洗脱
● MRM方式可以不必所有峰都基线分离,但要注意避开
基质离子抑制的干扰
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