海洋微生物宏基因组工程进展与展望.pdfVIP

47 卷 　3 期 ( ) 微 生 物 学 报 47 3 : 548～553 2007 年 6 月 4 日 Acta Microbiologica Sinica 4 June 2007 海洋微生物宏基因组工程进展与展望 1 1 1 1 2 李 　翔 ,秦 　岭 ,戴世鲲 ,姜淑梅 ,刘志恒 ( 1 中国科学院南海海洋研究所 海洋药物重点实验室 　广州 　510301) (2 中国科学院微生物研究所 　北京 　100080) 摘 　要 :据初步统计 ,生活于海洋环境包括大洋深处的微生物有 100 万种以上 ,构成了一个动态的遗传基因库 ,其 中绝大多数微生物或者从来没有经过实验室培养 ,或者至今无法培养 , 因而其分类地位及其生态学功能尚未为人 类所认识 。随着 16S rRNA 序列分析与系统分类学的广泛应用 ,海洋微生物多样性研究领域已经发生了很可观的改 变 ,这些变化极大的丰富了人们对的微生物多样性及其生态功能的认识和理解 。这里结合笔者近十年来的工作实 践 ,讨论近年来在海洋微生物资源开发利用方面的研究进展 ,提出一个带有自动化特征的宏基因组功能表达平台 , 探讨海洋微生物资源利用的新途径 。可以预见在不久的将来 ,海洋环境宏基因组工程研究将在一定程度上使得传 统未培养海洋微生物基因资源及其功能产物能够为人类所开发和利用 。 关键词 : 宏基因组学 ;微生物多样性 ;海洋药物发现 ;细菌人工染色体 中图分类号 :Q78 ;Q933 　　文献标识码 :A 　　文章编号 (2007) ( ) 　　从 1929 年发现青霉素以来 ,人们已经从微生物中开发 基因库 GenBank 中不断增加的 16S rRNA 及基因组序列数据 了一百多种临床使用的抗生素 ,抗癌和抗病毒药物 。然而 , 库 ,为微生物系统分类提供了相当丰富的种源信息 。目前微 ( ) 生物学界所公认的原核生物分类系统中 ,原来 11 个单列的 近几年来人类病原菌抗 耐 药性迅速发展 ,新的传染病隐患 日益加深 ,但是从可培养微生物中发现新型生物活性物质的 “门”的设定[ 1 ,2 ] 已经为 53 个分类学意义上“门”的系统分类 研究却趋于停滞 ,为此科学家们将研究的重点从陆地微生物 所取代 ,形成了现代微生物学的分类学基础[3 ,4 ] 。 ( ) 转移到海洋微生物 ,希望在海洋药物开发方面突破药物来源 宏基因组 metagenomics 工程 ,直接将特定环境中的总体 方面的瓶颈 ,从而高效而可持续开发利用浩瀚海洋中丰富的 遗传物质 ,克隆到可培养的宿主细胞中 ,建立宏基因组文库 , ( ) 微生物资源 。