Ydj1p二聚体中β14～β15与domain-Ⅲ分离的拉伸分子动力学模拟研究.pdfVIP

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2015-09-30 发布于湖北
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Ydj1p二聚体中β14～β15与domain-Ⅲ分离的拉伸分子动力学模拟研究.pdf

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Ydj1p二聚体中β14～β15与domain-Ⅲ分离的拉伸分子动力学模拟研究.pdf

V01．11 第11卷第3期生物信息学 No．3 2Ol Chinese ofBioinf0珊atics 3年9月 Joumal Sep．，2013 doi：10．3969／j．issn．1672—5565．2013．03．02 1 1 Ydj p二聚体中p14～13 拉伸分子动力学模拟研究王浩1，徐利楠1，孙玉娜1，沈曼莉2，薛友林3，李辉1，宋有涛1’2+ 摘要：分子伴侣Hsp40是一种以二聚体的形式调控非天然多肽折叠的热激蛋白。本文通过拉伸分子动力学研究了酵母 p14一B15中的残基111 Ydjlp二聚体结构。关键词：分子伴侣；Hsp40；Ydjlp；二聚体；拉伸分子动力学中图分类号：R978．1+6文献标识码：A 文章编号：1672—5565(2013)一03一167—05 Steeredmoleclnar simulationofthe dynamics bindin2 of in anddomain—III dimer B14～D15 Ydjlp WANG Ha01，XULi—nanl，SUNYu—nal，SHENMan—li2， XUE You—ta01·2+ You—lin3，UHuil，SONG (1．cof妇℃矿№sc拓，耽，“∞ni增UⅡi坩巧妙，Sk叩增110036，C^iM；2．S如00fo，En撕ron，聊mⅡf ．s出M，“∞戚，lg妇矗哪咖，s^∞弦ngll0036，c^讥o：3．cof姆eo厂坎m，以删，y，如oning如沁n咖，SknyⅡ，lg110036，肌泐) molecular functionsasadimerto non-native Inthis AbstRlct：T11e chaperoneHsp40 regulate polypeptidesfolding． have steeredmolecular to thedissociationbe- study，we ped’0珊ed dynamics(SMD)simulationinvestigate pmcess tween the anddomainIIIjn c—te瑚inaJ funher the D14～p15 yeastHsp40homoJogueYdjlp dimer，andinvestjgate residuesandinte珊olecularinteractionsthat l dimer OurdataindicateIes- importaJlt innuencingYdjp stability． that idues andPhe375iscriticalfor 1 dimer Thr366and Thr366、