震旦鸦雀指名亚种(Paradoxornisheudeiheudei)种群遗传结构和种群动态分析.pdfVIP

摘要 震旦鸦雀指名亚种(Paradoxornis heudei heudei)种群遗传结 构与种群动态分析 解文利 (南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所，南京 210046) 中文摘要 震旦鸦雀（Paradoxornis heudei ）为全球近危种，共有2 个亚种，其中指名 亚种（P. h. heudei ）分布在长江中下游及浙江、江苏沿海的部分地区；黑龙江亚 种（P. h. polivanovi ）分布于我国与俄罗斯接壤的兴凯湖附近区域、黑龙江的扎 龙、辽宁的盘锦以及内蒙古等地。本研究通过对线粒体 DNA 控制区序列和 9 个 微卫星位点的变异分析，探讨了震旦鸦雀指名亚种的遗传多样性、种群遗传结构 和种群动态。 1、通过对震旦鸦雀指名亚种的大丰、六合、洪泽湖和东营4 个地方种群共 100 个体的 mtDNA 控制区序列(1086 bp)分析，发现了 7 个变异位点，共定义了 7 个单倍型。种群总体上的单元型多样性为 0.688，核酸多样性为 0.00114 。基于 控制区序列的分子变异分析表明，地方种群并没有形成显著的遗传结构，不同地 方种群间的遗传分化并不明显，可以作为一个单元进行保护与管理。 2 、根据线粒体 DNA 控制区单元型的变异，推测震旦鸦雀指名亚种 4 个现生 种群最近共祖时间（TMRCA ）约在 1.8 万年前，震旦鸦雀种群在末次冰期可能 经历了一次强烈的种群瓶颈过程。歧点分布分析及 Tau 值估算的结果表明，震旦 鸦雀种群约在 7900 年前曾发生过分布区的扩张。本研究中涉及到的现生种群可 能是由经过瓶颈后的孑遗种群在冰后期经过种群扩张所形成。 3 、震旦鸦雀指名亚种 96 个体的微卫星位点的分析，发现平均等位基因数 （A ）为 10.67±2.55，平均期望杂合度（HE ）为0.802±0.068 。震旦鸦雀指名亚种 种群在核基因水平表现出较丰富的遗传多样性。哈迪-温伯格平衡分析表明，各 I 摘要 震旦鸦雀指名亚种种群由于杂合子不足明显偏离了哈迪-温伯格平衡，地方种群 间FST 分析表明，几个地方种群间已经发生显著遗传分化。根据微卫星的变异分 析，推测震旦鸦雀指名亚种种群间在核基因水平上的分化发生在距今 147 年至 706 年之间。 4 、因子相关性分析得到四个地方种群个体的三维分布图揭示该亚种没有形 成明显的地理散布（Geographical dispersal ）界限或主要分类组（Major taxonomic ）； 基于贝叶斯方法的种群结构分析结果表明，现生震旦鸦雀指名亚种各个地方种群 之间应当具有混杂的共同祖先，在历史上曾有丰富的基因流。根据突变-漂移平 衡分析表明，震旦鸦雀指名亚种种群在 IAM 模型下显示出显著的杂合过剩，这 表明震旦鸦雀指名亚种种群在近期可能经历过瓶颈效应，栖息地破碎化引起种群 数量的下降。 关键词：震旦鸦雀指名亚种；微卫星；线粒体 DNA 控制区；遗传多样性；种群 结构；种群动态 II 摘要 Research of genetic structure and population demography of reed parrotbill (Paradoxornis heudei heudei ) XIE Wen-li (Institute of Genetic Resources, College of Life Science, Nanjing Normal University, 210046, Nanjing, China) ABSTRACT