蛋白质组学分析技术在微生物研究中的应用耿伟平.pdfVIP

生物技术通报 年第 期 ·技术与方法· BIOTECHNOLOG Y BULLETIN 2008 6 蛋白质组学分析技术在微生物研究中的应用 耿伟平 吴晨紫 杨志伟 （首都师范大学生命科学学院，北京 100048） 摘 要： 随着后基因组时代的到来，蛋白质组学分析为研究微生物的生命活动和细胞功能提供了一个广阔的视 角。综述了大规模分析微生物蛋白质组的策略和方法，包括自上而下的蛋白质组学分析、自下而上的蛋白质组学分析、蛋 白质组定量分析技术、蛋白质修饰研究方法和蛋白质芯片技术。最后，对沙门氏菌蛋白质组学的研究进展进行了简要介 绍。 关键词： 微生物 蛋白质组学 鼠伤寒沙门氏菌 Application of Proteomic Techniques in Microbial Research GengWeiping WuChenzi YangZhiwei （College of Life Sciences ，Capital Normal University ，Beijing 100048） Abstract -down analysis，bottom- Key words ：Microorganism Proteomics Salmonella typhimurium 蛋白质组学是指研究一个细胞、一个组织或一 因组、 转录组分析的蛋白质全谱研究已有成功报 种生物在给定的时期、特殊条件下表达的所有蛋白 道，采用微生物材料进行蛋白质组学研究具有一些 质的总和。 蛋白质组远比基因组庞大和复杂，在细 显而易见的优势。 微生物结构简单，易于培养和处 胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活动中及外 理，突变株容易获得；基因组相对较小，许多微生物 界环境的刺激下，蛋白质在表达时序、表达量上表 已完成基因组测序，很多哺乳动物代谢过程中所需 现出很大差异， 出现复杂的连锁反应和级联反应， 基因在微生物体系中也是保守的，因此微生物是研 所有这些变化皆处于一个相互交错和精密调控的 究蛋白质网络体系的理想模式生物。 代谢网络中。 蛋白质组学研究通过对生物体内表达 1 研究策略和技术 的各种蛋白质进行识别和定量分析，确定它们在细 1.1 自上而下蛋白质组学分析（Top-down ） 胞内外的定位、修饰、相互作用和功能，以期获得对 Top-down 利用高分辨质谱直接对完整蛋白质 生命本质和活动规律的全景式认识。 进行研究，且在质谱分析前不需要对蛋白质进行酶 微生物蛋白质组学研究进展很快。 自从1995 解，从而有利于蛋白质的一级结构和蛋白质修饰的 年的流感嗜血杆菌基因组测序完成之后， 相继有 分析。 目前，此方法已经成功地用于确定Bacillus 芽 200 多种微生物的基因组完成了测序，其中大约有 [1] 孢的起源 及Enterobacter skazakii 病原性生物标记 40% 是重要的人类病原菌，为进行微生物蛋白质组 [2] 的研究 。 这一方法的局限性在于对于不易离子化