福氏5b痢疾杆菌基因组以的比较基因组.pdfVIP

摘要 痢疾是威胁我国人民健康的重要传染病。志贺菌属福氏造成的痢疾普遍存在于发展中和发达 国家。国际上针对志贺菌福氏开展的研究工作较多，历史也较悠久，并且大多是以福氏2a和福 氏5作为研究对象。现在国际上已经完成了5株志贺菌属基因组，分属于不同的血清群。这些志 贺菌基闻组的完成揭示了该菌属的遗传特征的多样性。为了进一步研究志贺菌属中同一血清群不 同血清型之间的异同，我们采用“鸟枪法”测序，在国际上首次完成了志贺菌福氏5b8401菌株(简 称Sf8401)1)cJ全基因组序列并进行了注释，并把它与志贺菌福氏2a301株(St301)进行了同一血清 群不同血清型的比较基因组学的研究。 bp，共包含4。714 1)St8401的全基因组是一条环形染色体。染色体基因组全长4，574，284 偏爱性。同时在StSdOl当中发现了针对大肠杆菌和志贺菌特异的28个ORFs。 ∞通过与Sf301的比较，发现两者大约有97％的基因组序列是共享的，这些共享的序列说明它 们之问非常保守的进化关系。同时在基因组的结构上两者大致呈现出线性结构，但是这种线性结 构被6处翻转和1处迁移所打断。进一步的研究发