南江黄羊生长轴主要基因多态性及生长性状关系.pdf

摘要 为寻找南江黄羊快长品系标记辅助选择可用的分子标记，本研究将以405只南江黄羊为试验 技术和DNA序列分析技术筛选其多态位点，并与南江黄羊的生长性状进行关联分析，以期筛选与 南江黄羊生长性状相关的分子标记．本研究分五个部分进行： 1 检测了GH基因外显子3、外显子4、外显子5和内含子2的多态，序列分析比对结果发现 外显子3有2个SNPs 98G／A；108G／A ，外显子4有个4SNPs 27G／A；68C／A；136G／A；170C／T ， 外显子5有3个SNPs 06c化187c化202CO 和1个碱基插入 241c插入 ，其中有5个SNPs引起 了氨基酸替代；与南江黄羊生长性状的关联分析结果显示：外显子3的SNP多态与2月龄体重、周 岁体重和体商、胸围性状存在显著相关 p 0．05 ，BB基因型是周岁体重、体高和胸围性状的有 利基因型，其在发挥效应上表现为显性；外显子4的SNP多态与初生重、2月龄体重、6月龄体重和 部分体尺指标显著相关 P 0．05 ；FF基因型是初生重、2月龄体重、6月龄体重、2月龄体长和2 月龄胸围的有利基因型。其相关是来自于136位点 G／A 转换效应 同义突变 。外显子5多态 与生长性状无关。 2 克隆得NCHR基因的8个外显子，检测了10个外显子和5’调控区的多态，结果表明：在 示该多态与2月龄体重、6月龄体重和周岁体重有关系，BD基因型个体的2月龄体重显著低于其他 基因型个体 ， o．05 ；DD基因型个体的周岁体重显著低于AA基因型、BB基因型和CC基因型 等位基因是生长性状的不利基因。GHR基因的104、。#y显子上未检测到多态。 3 检测了IGF-I基因4个外显子和5’调控区多态，结果表明：在外显子4的编码区外 内含 子4 上存在G／C颠换多态，并与初生重和周岁体重有关系 P 0．05 ，CC基因型初生重显著高于 对6月龄体长、6,9龄体商、周岁体长和周岁体高的影响接近显著 P． o．1 ，在这四个体尺性状上， 都表现为CC GG CG．初步认定CC基因型可能是初生重和周岁体重和周岁体尺的有利基因型。4 个外显子与57调控区未检测到多态。 4 克隆得到南江黄羊GHRH基因部分片段 外显子2、内含子2和外显子3 ，并检测了该片 段多态性，结果发现该片段不存在多态，6种生物 人、鼠、猪、奶牛、绵羊和山羊 该片段编 码区序列同源性较高，保守性强。 5 检测了IGFBP3外显子2，内含子2、外显子3和外显子4的多态，结果表明在这4个位点不 存在多态。 GH基因外显子3、外显子4、GHR基因57调控区和IGF-I基因内含子4上的多态可能是与南江黄 羊生长性状相关的分子标记，但还需要在南江黄羊群体和其他山羊品种中进一步的验证。 关键诃：生长轴主要基因，多态性，生长性状，南江黄羊 Abstract The wasconductedtofindthe markersassociatedwiththe traitsin presentstudy genetic growth total formarkerassistedselectionlinewith rate．A of405 higher NanjiangHuanggoats growth wereusedtodetectthe aixs NanjiangHuanggoats polymorphismsofmajorgenesofgrowthincluding GHRH andIGFBP3to whethercouldbe gene，GHgene，GHRgene，IGF-Igene geneanalyze they candidateormolecularmarkersto the traitsin genes improvegrowth NanjiangHuanggoats．Five forthis l：the weredetectedat were exon3， experimentsdesignedobjective．Experimentpolymorphisms exon4andexon5ofGH results and showedthat2 gene．Theofsequenceanalysismegalign SNPs 98 inexouofGH indentifed3 G／A；108G／A was gene，4sNPs 27G／A；68C／A；136G／A；170C门_ ilI exon4ofGHand3 C／T；187C／T；202 l C exert5 gene SNPs 36 C／T andinsertion 241insertion in ofGH