氨基酸和寡的结构与性质的理论研究.pdf

摘要 摘 要 氨基酸和寡肽是重要的生物小分子体系，对它们的理论计算研究不仅可以 帮助解释对这些体系所开展的实验研究的结果，还可以为人们更清楚地认识和 了解例如蛋白质分子这样大的生物分子体系奠定峰实的基础。 本论文利用基于密度泛函和波函理论的计算方法详细研究了典型的氨基酸 和寡肽分子体系的结构和性质。研究涉及方法的发展，方法的测试和方法的应 用，其内容涵盖了氨基酸和寡肽理论计算研究领域的多个方面。 第l章中我们简要介绍了用于研究分子体系的主要计算方法的理论基础， 包括各种从头计算方法，半经验方法和密度泛函方法。同时对用于描述诸如电 荷和轨道等化学经验概念的理论方法进行了阐述。最后对本论文研究所要用到 的各种计算软件包加以简单说明。 第2章给出了氨基酸和寡肽分子体系理论计算领域的主要研究内容和研究 热点，这包括氨基酸和寡肽分子的稳定结构，电子性质，内部弱相互作用，质 子化和去质子化过程，构象转换，金属离子结合及溶液效应等多方面的研究。 这为本论文提供了研究方向上的指导。 第3章中我们利用密度泛函方法系统寻找了缬氨酸分子的稳定构型，对前 人的研究工作给出的缬氨酸分子