小波分析和分形论处理化学生物信息的新研究.pdf

小波分析和分形理论处理化学生物信息的新研究 (分析化学专业) 博士生：陈晓燕 指导老师：莫金垣 摘 要 二十一世纪，自然科学的研究焦点已经从获取信息发展到挖掘信息、理解信息。把数理 统计学、计算机科学和信息科学等学科的新概念、新成就引入分析化学及生物工程的研究。 将推动和促进化学信息和生命科学新原理、新方法和新技术探索的发展。在化学信息学和生 物信息学中，有用信息的提取和数据处理对提高分析仪器的检测性能、降低检测限以及理解 生物体的内部信息模型等具有重要的意义。 本文通过详细研究小波分析和分形理论的理论特征，结合分析化学数据信号的基本特 征，致力于研究化学计量学中新的分析信号处理方法，并把建立的新技术应用在化学和生物 信息的处理上。建立了一系列的信息的提取和处理新技术．包括复合信号的分辨、最优滤波 和核酸序列的解析几个方面，其主要内容如下： 1．首创“分形分辨重叠峰算法”，有效简便地分离重叠的仪器信号。将分形理论用于 仪器分析信号的解析，提出一种面向分析谱图中重叠信号处理的分形分辨算法。通过对信号 进行分形分析，采用分形维数有效反映信号的特征，准确地得到谱峰个数和位置的信息，避 免人为判断的误差。实验表明，这种新的重叠谱峰分辨法适用于光谱、电化学、色谱等仪器 分析数据的处理，即使分离度为0．6的重叠信号也能得到满意的结果。它的突出特点是能用 分形维数直接判断重叠的信号．不必了解信号频域的细节。我们详细研究了分形分析的理论 特性，提出了具体的解析算法，构造了单组分到五组分重叠谱峰的模拟信号进行理论实验。 原本重叠的信号经过处理后，其峰形变窄，而峰位置、峰面积基本不变，分离程度大大提高， 实现了基线分离。即使宽窄不同、分离程度不同的信号，也可以得到很好的估计，并实现分 离。重叠的信号被处理后都可达到提高分辨率的目的，算法简单，方便易行。这种方法无须 限制信号长度为2”个数据点，可适用于任意长度的信号，对实验数据更加实用。 2．建立了。离散小波阈值去噪法”，应用于电化学发光检测(ECL)的毛细管电泳(CE) 测方法，由于受周围环境和仪器本身的影响，以及TBR与OH-的反应．使采集到的信号波 动较大，因此要得到预期的高灵敏度和准确性就必须对信号做滤波的处理。但用以往传统的 滤波方法来处理此类带有相关性噪声的信号，却不能得到满意的结果。我们基于小波变换域 内系数相关性，设计适当的方法，使信号增强、噪声减弱。详细考察了多种典型小波函数， 置方法，并结合Soit函数或Hard函数的闽值消噪处理。最后确立滤波的最佳策略为分解尺 4小波基，结合heuristic 度5的Symlet Fourier变换相比较，我们的方法能有效地去除噪声并更好地保持原信号的峰形。 3．首次开发了第二代小波的全新滤波方法一“提升格式小波滤噪法”。传统小波的 构造是通过对函数的平移和伸缩并结合Fourier变换技术来实现的，提升格式与传统方法的 主要区别就是它完全不依赖于Fourier变换，在空域完成了对双正交小波滤波器的构造。与 传统的小波变换相比，提升小波结构简单，运算量低；原位运算，节省缓存空间；逆变换通 过结构翻转得到，具有诸多实现上的优点。从提升格式的结构出发，设计了完全自适应的消 噪方法，可以处理信噪比低至O．2的信号，对高噪声化学信号的处理结果信噪比提高几百倍， 峰位置相对误差小于1．O％，应用于氨基酸体系毛细管电泳检测信号的处理，有效降低了实 验噪声的影响，分辨提取了难以察觉的信号，结果大大提高了峰的分辨率，验证和显示了方 法的可行性和优越性。 4，创建了墨西哥帽小波研究核酸序列分形特征的提取方法。根据尺度不变性的分形概 念可以用来研究复杂的基因结构。我们结合小波分析和分形理论，采用分数布朗运动(FBM) 建立数学模型，研究脱氧核糖核酸(DNA)序列的自相似性。用DNAwalk的方式将DNA序列 表达成为数字信号，通过不同小波变换的尺度对应不同特征长度的碱基，选择墨西哥帽小波 为母小波，进行实验考察，结果发现小波系数的图形在许多尺度看上去很相似，大尺度对应 较多的碱基(小波变换尺度为2 7时，对应512个碱基)，能看到概貌；小尺度对应较少的碱 基(小波变换尺度为23时，对应32个碱基)