分子动力学模拟法应用研究.pdf

摘 要 ，，—、f由于在一定温度的条件下，物质的分子总是处于不断运动的状态中的。分子动 力学模拟方法能够模拟分子的运动状态，成为研究分子间相互作用的一种重要方 法，近年来，随着计算机技术的发展，使得分子动力学模拟这种较为真实和直观的 ＼／ 方法的应用范围越来越广泛了。／ 本论文主要以如下四个方面的工作对分予动力学模拟进行了研究： 一、用分子动力学模拟方法研究磺酰脲化合物在溶液中的性质、 、、／由于药物分子通常在溶液中起作用，溶液中构象对其活性有很大影响。利用分 子动力学模拟的方法，研究各种磺酰脲类化合物在极性和非极性溶液中的构象情 况，并应用从头算的方法得到了这些构象的偶极距和其他一些性质，得到如下结 论： 磺酰脲化合物在极性溶剂中呈现出弯曲构象和伸展构象并存的情况，而在非极 性溶剂中主要处于伸展状态。在两种溶剂条件下，磺酰脲化合物的构象变化趋势导 致其偶极距与溶剂的偶极距的情况相一致，并且使能量最小化。同时，在各种情况 下伸展构象都占优势的主要原因在于伸展构象的分子运动自由度比较大。这也是体 现了利用分子动力学模拟方法比秘用一般的