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C O B R A 模 型上代谢调控 约束 的定量化研 究
Q u antitativ e R esearch of th e R egu latory C on stra in ts
o n M e ta b o lic C O B R A M o d e l
谢 东 强
指 导 小组 成 员名单
王 飞 副教授
目 录
ffi w I
A b s t r a c t I I
第 一 章 绪 论 i
1.1 C O B R A 代谢 网络 建 模框 架 和生 化 网络 整合 研 宄 1
1.1.1. 基 于 理 论 的建 校 丨
1.1.2 . 基 于 约 束 的建 模 1
1.1.3. C O B R A 建 模 框 架 3
1.1.4 . 流 量 均 衡 分 析 （F B A ) 4
1.1.5. 代 谢 网络 分 析 方 法 的发 展 6
1.1.6 . 代 谢 网络 C O B R A 建 模 的发 展 7
1.2 集 成 调控 网络 的代 谢 网络 研 究 7
1.3 本 文 的主 要 工 作 10
第 二 章 COBRA 模 型 代 谢 调 控 约 束 的 定量 化 研 究方 法 12
2.1 方 法 流 程 及 简述 12
2.2 基 因芯 片数据 二 元 化 (B inarization ) 13
2 .3 基 因之 间 的调 控 分析 及 调 控 定 量 化 计 算 15
2 .3 .1 规 则转 换
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