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南太平洋环流区表层海水微生物群落结构研究 摘要 介于20__45。S的南太平洋环流区是世界上最大的大洋环流区，其环流中心 与陆地距离最远，广阔的环流区远离近海的扰动，囤积了大量相对沉寂的海水， 而且具有寡营养、强紫外线照射等特征，使得南太平洋环流区的表层海水成为 世界上最干净的水体，其叶绿素和初级生产力水平均低于其他洋区。海洋微生 物的群落组成是海洋生态系统的重要组成部分，在海洋生物地球化学循环中起 到重要作用。在南太平洋环流区表层海水这一世界上最干净水体的特殊海洋生 态环境中，会形成特殊的海洋微生物群落结构。本论文旨在通过对南太平洋环 流区表层海水海洋微生物群落组成以及可培养细菌多样性的研究，首次揭示环 流表层海水微生物的多样性和群落组成，对于进一步了解南太平洋表层海水的 微食物环的形成，乃至填补全球海洋表层海水生态系统的空缺有非常重大的意 义。 表层海水样品来自2010年10月9日至12月13曰美国的大洋钻探船“乔迪 Ocean 斯·决心号”执行的综合大洋钻探计划329航次(IntegratedDrilling 水到滤膜上，．80。C冻存。同时用浓缩海水样品在2216E和R2A培养基上进行 涂布，筛选可培养的细菌。从涂布的2216E平板和R2A平板中分离到255株细 菌并保种，选取74株细菌进行16SrRNA基因序列测序。 rRNA基因扩增，对 提取四个站点表层海水总DNA进行细菌和古菌的16S 构建的8个16SrRNA基因克隆文库进行多样性分析，并对其中1200个克隆进 行了16SrRNA基因序列测序。所得到的南太平洋环流细菌克隆共757个，主要 6一变 向外沿逐渐减小。变形菌门中又以Ⅱ．变形菌纲占优势，p-变NN-NN 形菌纲只在环流中心被检测到。蓝细菌门(Cyanobacteria)是第二大类群， 30．1％， 16．1％，U136924．5％)比例小于环流的外缘(U1370 环流中心(U1368 U1371 逐渐增加。南太平洋环流古菌克隆共得到355个，几乎都归为广古菌门 III。由 II，只有一个克隆属于MarineGroup Group (Euryarchaeota)的Marine 此可见，南太平洋环流细菌多样性比较低，并且环流的中心和外缘在细菌 的组成与优势菌群的种类上区别较大。 对四个站点总环境DNA进行的几个主要类群微生物的荧光定量PCR分析 显示，细菌16S 8．87×105，2．55×106和1．26x106ml一，古菌16SrRNA基因拷贝数从中心 copies 7 7和1．13x10 到外沿(U1368．U1371)分别为1．17×106，4．01×106，1．90×10 copies 区的微生物量非常低，属于超寡营养的生境。 t 基于16S rRNA基因序列分析发现，一共有14株细菌(b-18．9％)鉴定为潜在的 新种，其中有6株与已知细菌的相似度低于94％，为潜在的新属。这表明了南 太平洋环流是一个非常特殊并且具有巨大新型生命活力的地区，对这一区域微 生物群落的研究将对整个海洋生态系统的分析具有重大的意义。 关键词：南太平洋环流；细菌；古菌；16S