序列比对(生物数据库搜索).pptVIP

复习： 数据库查询 所谓数据库查询，是指对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。数据库查询有时也称数据库检索，它和互联网上通过搜索引擎 (Search engine) 查找需要的信息是一个概念。 请大家操作！ 利用NCBI中的查询工具Entrez找出蛋白质序列数据库SwissProt中有关人（HOMO）的insulin(胰岛素) 或与胰岛素有关的序列条目。 利用NCBI中的查询工具Entrez找出PUBMED数据库中最近3个月insulin(胰岛素) 或与胰岛素有关的文献条目。 数据库搜索在分子生物信息学中有特定含义，它是指通过特定的序列相似性比对算法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与检测序列具有一定程度相似性的序列。在生物信息学中，数据库搜索是专门针对核酸和蛋白质序列数据库而言，其搜索的对象，不是数据库的注释信息，而是序列信息。 数据库的搜索 在分子生物学研究中，对于新测定的碱基序列或由此翻译得到的氨基酸序列，往往需要通过数据库搜索，找出具有一定相似性的同源序列，以推测该未知序列可能属于哪个基因家族，具有哪些生物学功能。对于氨基酸序列来说，有可能找到已知三维结构的同源蛋白质而推测其可能的空间结构。因此，数据库搜索与数据库查询一样，是生物信息学研究中的一个重要工具。 生物信息学实验 实验二 Blast介绍及应用 一、实验目的 了解和掌握数据库搜索工具