08112003249梁庆建[开题报告].docVIP

毕业设计（论文） 开 题 报 告 题 目 B细胞受体（BCR）的生物信息挖掘 学 院 生命与环境科学学院 专　业 生物技术 班　　级 08生技二08112003249 学生姓名 梁庆建廖志勇 21世纪自然科学的核心领域----生物信息学(bioinformatics)，它是一门交叉科学，以计算机为工具对生物信息进行获取、处理、储存、分发、分析、检索和解释的科学，用来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。其研究重点主要包括基因组学（Genomics）和蛋白质组学（Proteomics）两方面，还涉及基因与蛋白质的关系如蛋白质编码基因的识别及算法研究,蛋白质结构、功能预测及各生物种间的进化关系等其他信息资源。 生物信息学时从多方位、多角度来认识生物的本质，全面了解生物信息的组成和结构，破译和解释生物信息之间的关系。认识生物本质，了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系，改变生物学的研究方式，改变传统研究方式，引进现代信息学方法，为疾病的诊断和治疗提供依据，为设计新药提供依据。生物信息学的发展对分子生物学、药物设计、工作流管理和医疗成像等领域产生巨大的影响，极有可能引发新的产业革命。同时，生物信息学所倡导的全球范围的资源共享也将对整个自然科学乃至人类社会的发展产生深远的影响。 B细胞抗原受体（B cell antigen receptor，BCR）是由膜免疫球蛋白（mIg）和Igα/Igβ组成的异源寡聚复合物。在成熟B细胞表面，Iga、Igp总是和BCR共同表达，形成BCR-Igα/Igβ复合体，mIg识别抗原，Igα/Igβ转导mIg接受抗原刺激信号。研究表明mIgM和mIgD的胞内区仅由3个氨基酸组成：Ig-α（32/33KD）,Ig-β(37KD)和Ig-γ（34KD）。Ig-α由mb-1基因编码，Ig-β和Ig-γ由B29基因编码。Ig-γ表达于正常脾B细胞，Ig-γ非对称性分布于B细胞亚群。Ig-α（MB-1）和Ig-β/-γ（B29）均为Ig超家族成员，在结构上划分Ig样胞外区、跨膜区和胞内区；Ig-α的胞内区含61个氨基酸残基，Ig-β含48个氨基酸残基。Ig-α和Ig-β包含一段长26个氨基酸的特别序列，命名为ARH1（antigen receptor homology 1）。ARH1还存在于Ig-γ，CD3ε，CD3γ，CD3δ，TCRζ(3 copies)，TCRη（2 copies），FcεRIβ，FcεRIγ，FcεRⅡα，Ig-γ只包含ARH1的一部分。ARH1序列的作用是偶联受体与细胞内信号传导途径，导致酪氨酸激酶的活化和IL-2的产生。Blk、Lyn、Fyn、Lck等Src-家族成员可与脾B细胞的mIg结合且mIg的交联可导致这些激酶的活化。BCR通过Cμ4和Ig-α的胞外区，μ链跨膜区（TM）的TTAST序列和Ig-αTM的谷氨酸使信号从mIg向Ig-α/Ig-β传导。在静止的BCR中，mIg通过胞外和跨膜接触点与Ig-α和Ig-β/-γ异质性二聚体非共价结合；μ-链的胞内区序列-YSTTVT-与Syk结合；与此同时Ig-α和Ig-β还形成和多种胞内效应酶的结合位点，Ig-α与Lyn、Fyn、pp38结合，Ig-β与pp40、pp42结合。当BCR与抗原或其它配体结合时引起受体交联产生失力，使mIg跨膜区向上滑动，导致μ-链胞内区的-YSTTVT-序列埋入胞膜脂质双层，Syk被解离。Syk因此而活化，使Ig-α和Ig-β磷酸化并同时使与受体连接的Lyn和或者Fyn磷酸化；Ig-α和Ig-β磷酸化改变了它们与pp40、pp42、pp38、Lyn和Fyn的连接，使后者得以完成一组分多样、结构复杂、功能广泛的膜受体复合体。 BCR和一些辅助受体及辅佐分子共同完成对抗原的识别及信号转导。信号转导的生物学效应几乎涵盖了所有的生命现象，研究信号转导途径去认识细胞增殖、分化、凋亡；以信号转导为理论，设计出以信号转导途径中起调节介导作用的信号分子（如激酶、配基或受体）为靶的药物调节控制信号转导途径来治疗疾病；以细胞作为敏感元件来研究信号识别、转导和信号指示过程的细胞传感器的新型快速检测技术，能用于疾病病原体诊断和有毒有害物质检测。信号转导研究室生物领域研究的热点，探索信号转导相互依存、相互联系及在一定基础上的统一性，不仅是研究信号转导网络的基本工作，解决识别信息网络这一难题的前景所在，而且借助细胞信号转导机制，为建立细胞模型的相关机制研究、疾病研究、诊断方法等方面提供理论与思路。 通过查阅文献了解细胞受体（BCR）的生物学特征，运用生物信息学工具（NCBI、EMBL、DDBJ 及dbEST、SWISS - PROT、PDB 、PIR 、TREMBL 和