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生物信息学及其在深圳的机遇与挑战 刘维湘 清华大学深圳研究生院 生命学部 生物医学工程研究中心 Email: victorwxliu@ QQ内容 生物信息学概况 生物信息学简介 生物信息学、生物学基础 历史、内容、任务、技术和方法 （系统生物学） 国内外状况 产学研实例 深圳的机遇与挑战 生物信息学人才培养和培训 个性化医疗 芯片技术产业与服务 生物数据挖掘与服务 产学研合作 三大自然科学之谜 宇宙的起源 生命的诞生 思维的奥秘 What is bioinformatics? from /wiki/Bioinformatics Bioinformatics and computational biology involve the use of techniques including applied mathematics, informatics, statistics, computer science, artificial intelligence, chemistry, and biochemistry to solve biological problems usually on the molecular level. Research in computational biology often overlaps with systems biology. Major research efforts in the field include sequence alignment, gene finding, genome assembly, protein structure alignment, protein structure prediction, prediction of gene expression and protein-protein interactions, and the modeling of evolution. 生物信息学 说文解字：生物 + 信息 + 学 (bioinformatics) biology + information + theory 广义 应用信息科学的方法和技术，研究生物体系和生物过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息，或者也可以说成是生命科学中的信息科学。 狭义 应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。 生命信息系统 生物所处的时空系统 物质系统，信息传递与控制，能量 相关学科图示 广义概念图示 狭义概念图示 总结：生物信息学 生物信息学(Bioinformatics) 是一门新兴的交叉学科，是生命科学领域中的新兴学科，面对人类基因组计划等各种项目所产生的庞大的分子生物学信息，生物信息学的重要性将越来越突出，它将会为生命科学的研究带来革命性的变革。 生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。 生物信息学是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一，其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白组学(Proteomics) 。 生物学基础速递 细胞(分子水平) 个体生命 生命之树 生命的分子基础 细胞/分子水平 DNA/RNA 蛋白质 糖 脂类 DNA结构和碱基互补原理 中心法则 中心法则的发展 遗传信息 DNA、RNA核苷酸序列 氨基酸 病毒/肽 表观遗传学 生物信息学的历史 从人类基因组计划（HGP）说起 生物信息学的研究内容 1、 生物分子数据的收集与管理 2、 数据库搜索及序列比较 3、 基因组序列分析 4、基因表达数据的分析与处理 5、蛋白质结构与功能预测 6、基因-蛋白相互作用网络 7、整个系统调控网络 数据库搜索及序列比较 搜索同源序列在一定程度上就是通过序列比较寻找相似序列 序列比较的一个基本操作就是比对（Alignment），即将两个序列的各个字符（代表核苷酸或者氨基酸残基）按照对应等同或者置换关系进行对比排列，其结果是两个序列共有的排列顺序，这是序列相似程度的一种定性描述 多重序列比对研究的是多个序列的共性。序列的多重比对可用来搜索基因组序列的功能区域，也可用于研究一组蛋白质之间的进化关系。 基因组序列分析 遗传语言分析——天书 基因组结构分析 基因识别 基因功能注释 基因调控信息分析 基因组比较 基因表达数据的分析与处理 基因