7_蛋白质高级结构2004.pptVIP

复旦大学生物化学系 黄伟达 蛋白质的超二级结构和三、四级结构 蛋白质的结构层次 一级结构：氨基酸序列 二级结构：α螺旋，β折叠 超二级结构 Module 结构域（domain） 三级结构：所有原子空间位置 四级结构：蛋白质多聚体 超二级结构类型 形成αα超二级结构的作用力 形成βαβ超二级结构的作用力 β-sheet 的拓扑学规律 超二级结构的类型 αα：keratin, myosin, βαβ、βββ：拥有β-sheet的蛋白质 形成超二级结构的作用力 β折叠在蛋白质中的不同形式 βαβ在蛋白质中(Rossmann折叠) 理论上四条β折叠有12种组合， 但是…… Greek key 的由来 β - sheet模式之一 β - sheet 模式之二 结构域 (domain) 在空间上相对独立的区域,是进化过程中不同基因融合的结果. 免疫球蛋白中的结构域 蛋白质的三级结构 蛋白质每个原子的空间位置，其主要研究方法是，X-光衍射 和核磁共振法。 X-RAY DIFFRACTION技术的历史 1895: W. C. Roentgen discovers X rays. 1912: Max von Laue discovers X-ray diffraction by crystals. 1913: W. L. Bragg reports the crystal structure of NaCl, providing the first experimental evidence for the absence of salt molecules. 1928: Kathleen Lonsdale reports the structure of benzene as having six equal sized bonds instead of alternating double and single bonds. 1935: J. M. Robertson et al. solve the structures of pthalocyanins, the first case of a complex organic molecule solved independently by crystallography. 1948: Bijvoet et al. solve strychnine, perhaps the first case in which crystallography decided between alternatives proposed by organic chemists. 1950: Bijvoet et al. establish the absloute configurations of dextro and laevo compounds with NaRb tartrate. 1949-57: Dorothy Crowfoot Hodgkin et al. solved the structures of penicillin (1949) and vitamin B-12 (1957). She won the Nobel Prize in Chemistry in 1964. X-RAY DIFFRACTION研究蛋白立体结构 1936年Max F. Perutz开始用X-光衍射技术来研究血红蛋白的立体结构 1945年Perutz的学生J. C.Kendrew开始研究肌红蛋白的结构 1957年肌红蛋白的结构确定, 1959年血红蛋白结构解明 两人于1962年获得诺贝尔奖. Laboratory procedure Must have a purified protein (or nucleic acid) Must be able to crystallize this molecule into a crystal from that is stable to irradiation by X-rays Mount the crystal in the X-ray machine Collect diffracted radiation on film or into an array of detectors Use a computer to carry out Fourier transforms on this density data From these spots (reflections) and t