生物信息学：功能预测与注释.pdfVIP

生物信息学 功能预测与注释 吴凌云 中国科学院数学与系统科学研究院 基因组注释 • Genome annotation • 利用生物信息学方法，对基因组各组成部 分进行识别，并对其生物学功能进行注释 • 主要内容 –基因识别与功能注释 –非编码基因的识别与功能注释 –调控元件的识别与功能注释 –影响染色体结构和动力学的序列 基因的识别与功能注释 • 基因预测 • 序列搜索 • 序列motif • 直系同源序列聚类分析（COG ） • 亚细胞定位 • 结构比较 • 蛋白质组学 序列搜索 • 假设：序列相似= 同源=功能相似 • 数据库 – NCBI-NT （非冗余核酸序列数据库） – NCBI-NR （非冗余蛋白质序列数据库） – InterPro （Swissprot ）（蛋白质序列数据库）