第二章 蛋白质_1-2创新.ppt

如χ为β-折叠，则为βββ。 如x为无规卷曲，则为βcβ。 纤溶酶原的ββ结构 （3）β-曲折（β-meander）： 是三条或三条以上反平行的β-折叠通过短链，如β-转角相连。 （4）β-折叠筒（β-sheat barrel）： 由多条β-折叠链所构成的β-折叠片，再卷成一个园筒状的结构。 锌指结构 (螺旋-折迭-折迭模序)? 转录因子MyoD的螺旋-环-螺旋模序 （5）HTH模体 4．结构域 概念： 二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体，称为结构域(domain)。 结构域是 1970年Edelman提出的，它是指在较大的球状蛋白质分子中，多肽链往往形成几个紧密的球状构象，彼此分开，以松散的肽链相连，此球状构象就是结构域。 最常见的结构域约含100～200个氨基酸残基，少至40个左右，多至400个以上。 结构域是球状蛋白质的折叠单位，多肽链折叠的最后一步是结构域的缔合。 对那些较小的蛋白质分子来说，结构域和三级结构往往是一个意思，也就是说是单结构域的。一般来说，大的蛋白质分子可以由2个或更多个结构域组成。 结构域有时也称功能域，功能域是指有功能的部分。功能域可以是一个结构域，也可以是两个或两个以上的结构域组成。 从动力学的角度耒看，一条长的多肽链先折叠成几个相对独立的区域，再缔合成三级结构要比直接折叠成三级结构更合理。 从功能的角度耒看，酶蛋白的活性中心往往位于结构域之间，因为连接各个结构域的常常是一条松散的肽链，使结构域在空间上摆动比较自由，容易形成适合底物结合的空间。 结构域的基本类型有全平行α螺旋结构域，平行或混合型β折叠片结构域，反平行β折叠片结构域和富含金属或二硫键结构域等4种。 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 来自番木瓜（Carica papaya）中的木瓜蛋白酶 木瓜蛋白酶 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 来自番木瓜（Carica papaya）中的木瓜蛋白酶 木瓜蛋白酶 来自番木瓜（Carica papaya）中的木瓜蛋白酶 木瓜蛋白酶 5. 蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构是指在二级结构基础上，多肽链再进一步折叠盘绕成更复杂的空间结构，三级结构主要靠非共价键来维持。 下面以鲸肌红蛋白为例，说明蛋白质的三级结构，1963年Kendrew等通过鲸肌红蛋白的x-射线衍射分析，测得了它的空间结构。　 肌红蛋白是由一条多肽链折叠盘绕成近似球状的构象。 (2) 主链的80%左右是右手螺旋，其余为无规卷曲，一条多肽链共有8个螺旋区（A、B、C、D、E、F、G、H），7个非螺旋区（二个在末端，中间有五个）。 (3) 氨基酸残基的亲水基团几乎全部分布在分子的表面，而疏水基团几乎全部在分子的内部。 (4) 血红素辅基垂直地伸出分子表面，通过一个His残基和分子内部相连。 从目前对球状蛋白质二、三级结构研究的资料来看，它们有一些共同的特点： (1) 在球状蛋白质分子中,一条多肽链往往通过一部分α-螺旋，一部分β-折叠，一部分β-转角和无规卷曲等使肽链折叠盘绕成近似球状的构象。 (2) 球状蛋白质的大多数极性侧链总是暴露在分子表面形成亲水面，而大多数非极性侧链总是埋在分子内部形成疏水核。 (3)