内蒙古锡林郭勒区健康家畜肠道菌群多样性研究.pdfVIP

摘 要 本研究运用纯培养技术结合16SrRNA基因序列分析方法对采集自内蒙古锡 林郭勒牧区的36份健康家畜(牛、马、山羊、绵羊)粪便样品中的微生物进行 技术对肠道微生物的多样性和数量进行了分析比较，以期为促进牧区家畜肠道有 益菌的开发和筛选奠定基础。试验结果如下： 1．结合形态学观察法，采用改良MRS培养基对肠道细菌进行分离，共获得 rRNA基因序列分析技术将所有分离株分类鉴定 179株细菌纯培养物。运用16S 到了14个属，32个种，包括乳杆菌属、丙酸菌属、链球菌属、埃希氏杆菌属、 葡萄球菌属、拟杆菌属、放线菌属、布劳特氏菌属、梭菌属、肠球菌属、双歧杆 菌属、肠杆菌属、克吕沃氏菌属和瘤胃球菌属。此外，从微生物多样性来看，牛 样品中的分离株主要集中于厚壁菌f-j(61．4％)、变形菌门(25．0％)和放线菌门 (11．4％)；马样品中的分离株主要集中于厚壁菌门(87．2％)和拟杆菌门(10．3％)； 山羊和绵羊样品的分离株主要集中在厚壁菌门(61．5％)和放线菌门(32．3％)。 2．运用PCR-DGGE技术研究家畜肠道菌群及乳杆菌属的多样性，结果表明 不同家畜肠道菌群及乳杆菌属构成存在差异，且组内样品间也存在一定差异。牛 肠道内的菌群多样性较高，其次为绵羊和山羊，马肠道内的菌群多样性较低，主 要的差异性菌种有巨大芽孢杆菌、维氏气单胞菌、小韦荣球菌、施氏葡萄球菌和 拉托氏假单胞杆菌等。此外，相较于马和山羊肠道内乳杆菌属的多样性，绵羊肠 L．taiwanensis、L．equi、发酵乳杆菌或阴道乳杆菌。 3．运用qPCR技术研究家畜肠道优势菌群的数量，结果表明：对于乳杆菌 和拟球梭菌，山羊、绵羊和马肠道内的数量显著高于牛，而它们三者之间无显著 差异；对于脱硫弧菌，四种家畜肠道内的数量相当：对于巨型球菌，绵羊肠道内 的数量显著高于牛和马，而山羊与其他三组之间无显著性差异；对于双歧杆菌和 瘤胃球菌，山羊肠道内的数量高于牛和马，而绵羊与其他三组之间无显著性差异； 对于密螺旋体，马肠道内的数量略高于其他样品。特别地，比较家畜肠道内各优 势菌群的数量，发现乳杆菌和双歧杆菌均低于其他5种优势菌群。 关键词：牧区家畜；肠道菌群：分离鉴定：多样性；数量 ofintestinalmicrobiotaof in livestock Diversity healthypastoral Inner XilinGol Mongolia Abstract Intestinal wereisolatedandidentified culturemethod microorganism usingpure and16SrRNA fromfeces of36 genesequencing healthy livestock， samples pastoral including and werecollectedfromInner cattle，horses，goatssheep，which Mongolia Xilin real—time G01．Meanwhile，denaturinggelgradientelectrophoresis(DGGE)and to the of quantityPeR(qPCR)wereappliedanal