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玉米大斑病菌cmp依赖性蛋白激酶a基因的克隆与功能分析
摘 要
玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica )是玉米上的一种重要丝状病原真菌,引起
的玉米大斑病(Northern Leaf Blight of Corn ,简称NCLB )是威胁玉米生产的一种重
要的叶部病害。研究表明,cAMP 信号转导途径在病菌的生长发育和致病过程中发挥
重要作用,蛋白激酶 A 是该途径下游的主要效应分子。本研究首先利用抑制剂试验
初步确定了基因的功能,应用候选基因法和 Genome Walking 技术克隆了玉米大斑病
菌的 cAMP 依赖性蛋白激酶 A 调节亚基基因(PKA-R )全长序列和催化亚基基因
(PKA-C )同源片段,并对其进行了生物信息学分析、基因缺失突变体分析等方面的
研究,为进一步明确 cAMP 信号转导途径在玉米大斑病菌致病过程中的作用提供了理
论依据。
本文利用 PKA 特异性抑制剂 H89 处理玉米大斑病菌孢悬液,结果发现分生孢子
的萌发和附着胞的形成均受到抑制。H89 随着浓度的增加,对孢子萌发和附着胞形成
的抑制作用明显增强;同一浓度下,抑制剂对附着胞形成过程的抑制作用大于孢子萌
发过程。初步确定了 PKA 在病菌分生孢子萌发和附着胞的形成过程中起重要作用。
根据已知植物病原真菌 PKA-R 和 PKA-C 基因的保守核苷酸序列设计简并性引
物,以玉米大斑病菌基因组 DNA 为模板,扩增获得了 PKA-R 和 PKA-C 基因的同源
片段。利用 Genome Walking 技术对所得的基因片段进行延伸,获得了 2688 bp 的
PKA-R 基因全长序列和 1382 bp 的PKA-C 基因片段。Southern 杂交技术确定了PKA-R
基因和 PKA-C 基因在玉米大斑病菌基因组中均以单拷贝形式存在。
生物信息学分析表明,PKA-C 基因编码氨基酸序列与烟草赤星病菌(Alternaria
alternata )、小麦颖枯病菌 (Phaeosphaeria nodorum )、小麦黄斑叶枯病菌 (Pyrenophora
tritici-repentis )等病原菌的PKA-C 蛋白同源性达 69%~85%;比对PKA-R 基因 DNA
和 cDNA 序列发现,该基因没有内含子,开放阅读框为 1398 bp,编码465 个氨基酸
残基;蛋白的分子量约为 50.437 kD,等电点 pI5.68 ,编码蛋白与小麦黄斑叶枯病菌
(P. tritici-repentis )、小麦颖枯病菌(P. nodorum )、灰霉病菌(Botryotinia fuckeliana )
等病原菌的 PKA-R 蛋白同源性达 58%~88%。PKA-R 蛋白为亲水性细胞质蛋白,没
有预测到信号肽和跨膜结构,二级结构预测表明,PKA-R 蛋白由 α-螺旋(34.84% )、
β-折叠(13.55%)、β-转角(4.52% )和随机卷曲(47.10% )组成。
为进一步研究基因功能,试验构建了 PKA-R 基因的双交换同源重组型基因敲除
载体及 PKA-C 基因的 RNA 干扰载体。对 PKA-C 基因的 RNA 干扰载体质粒利用 PEG
介导法转化玉米大斑病菌的原生质体,潮霉素筛选共获得了 11 个转化子。以潮霉素
磷酸转移酶基因 hph 为探针,经 Southern 杂交验证,确定了转化子 m5-1 为突变体。
对突变体 m5-1 进行表型分析,发现其生长速率降低,菌丝节间变短,且不产生分生
孢子。
关键词:玉米大斑病菌;环腺苷单磷酸;蛋白激酶 A ;RNA 干扰;功能分析
Cloning and Functional Analysis of the cAMP-dependent Protein Kinase A Gene in
Setosphaeria turcica
Author : WANG Miao-miao
Major : Plant Pathology
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