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水稻灌浆初期高胁迫下的籽粒全长cdna文库构建
摘要
摘要
前期研究中,本课题组采用基因差异显示技术和比较蛋白质组学方法获得了与水
稻灌浆期应答高温热害有关的54个差异表达基因片段和21个差异表达蛋白,但是
建水稻灌浆初期高温胁迫下的籽粒全长eDNA文库。本文以高温胁迫条件和常温对照
eDNA
条件下的水稻籽粒混合样品,利用Clontech公司生产的SMARTPCR Synthesis
化大肠杆菌DH5a;通过单克隆挑取和培养,获得了7974个阳性克隆,其中插入目
的eDNA片段大于1.0kb的克隆有5074个,占克隆总数的63.6%;插入目的片段小
于1.0kb的克隆数为2900个、占克隆总数的36.4%。
随机挑取其中34个克隆进行测序,测序结果在Genbank的水稻EST数据库比对,
结果显示插入目的片段大于1.0
kb的克隆中,75%为水稻EST数据库中最长的eDNA;
隆的数量和测序及比对结果可以看出,本文所建文库包含水稻中绝大多数基因表达的
eDNA信息,文库质量较好,为进一步获得与水稻灌浆期耐热性相关的差异表达基因
和编码差异表达蛋白基因的EST全长奠定了良好的基础。
关键词:水稻;灌浆初期;高温胁迫;籽粒;全长eDNA文库
Abstract
Abstract
In different and21 different
011Ipreviousstudy,54 fragments
expressinggene
functionalwereidentifiedcDNA-AFLPdifferent
displaying proteins by genes expressing
and 54different and21
technology
proteomics,respectively,however,thedisplaygenes
different functionalwere
notfull orderto fullthe
mRNA,In
displaying proteins length get
cDNA construction at
lengthmRNA,Full-lengthlibrary ofrice
panicleearlymilkystage
under this cDNAswere
stress.Thus,in
hightemperature study,fulllength synthesizedby
theSMARTPCRcDNA Kit Clontech themixed
Synthesis
producedby company,with
ofriceunder stressandnormalcultural
panicles hightemperature
an
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