水稻导入系群体性和粒型关联标记分析.pdfVIP

摘要 育性和粒型是水稻改良的两个重要的性状。本研究利用一套广亲和恢复系中 413为背景的多亲本导入系，即以全球130个水稻品种作为供体和“中413”作为受 体亲本，通过2—4次回交和2次以上自交纯合化的高代回交群体，以及由导入系 与三系不育系“玉A’和“川香29A”构建的测交群体，进行了育性与粒型相关基因的 分子标记关联分析。结果表明： 1、对育成的约2200个株系的导入系群体经目测选择长粒株系，测量粒长、粒 宽变幅为2．O一3．8mm，长宽比变幅为23—4．3，粒型变化明显。 2、参照康奈尔大学发布的分子标记连锁图，选出480个均匀分布于全基因组 的SSR标记和40个InDel标记用于群体检测和数量性状定位。显著性标记筛选工 作采用两个步骤完成。首先利用少量目标性状的极端株系进行全基因组分子标记扫 描，通过卡平方测验筛选显著性分子标记；接着对初步获得的相关标记，用更多表 型与轮回亲本有显著差异的株系进行验证，用卡平方测验筛选目标性状的关联标 记。 3、利用测交F1群体中不育和严重低育株系及高结实率株系，发现第l染色体 入片段置换了中413的恢复基因造成恢复性丧失或下降，也可能导入其他复等位基 因增强中413育性恢复能力。 4、通过粒重较轮回亲本显著增加株系分析，发现第3染色体RM347一RM520、 间有增加粒重的基因。通过粒型与中413显著差异导入系基因型分析，找到与粒型 关联的分子标记。 5、针对群体中高世代回交导入系的特点，设计不同比例的非对称混合样品池， 检测PCR扩增和电泳检测的效果，提出利用混合样初筛，再对阳性混合池进行单 株检测的二级标记分析策略，以提高非轮回亲本基因型的检出效率。 由于多供体亲本的导入系群体是一类新的定位群体，具有群体规模大、遗传结 构复杂、可以分析复等位基因遗传效应等特点，本文对多亲本导入系群体构建、标 记检测和数据分析方法，以及用于粒重粒型QTL定位的效果和混合池筛选等作了 初步分析讨论。 关键词：水稻导入系恢复基因粒型SSR标记InDel标记 Ill Abstract male dimensionaretwo traits Cytoplasmicsterility(CMS)andgrain of important rice as used130ricecultivarsthedonor andaCMSrestorcr improving．We parents 413”asthe ‘Zhong recurrent buildaset line parent∞)，to ofmulti-parentintrogressive 2-4times than (Ⅱ0populationby ofbaekerossesandmore 2times ofselfing．Test hybrid were crossesbetweenCMSlines‘‘Yu populationsdevelopedbymaking A’i 29Aandthe lines．TheassociatedmarkersforCMS “Chuanxiang intr