Agarose gel electrophoresis Gel electrophoresis is not only used as an analytical method, it is routinely used preparatively for the purification of specific DNA fragments. The gel is composed of: ? Agarose: for DNA fragments ranging in size from a few hundred base pairs to about 20 kb (Fig. 2.1). ? Polyacrylamide: for smaller DNA fragments. Agarose gel is a complex network of polymeric molecules whose average pore size depends on the buffer composition and the type and concentration of agarose used. ? In any event, gel electrophoresis is frequentlyperformed with marker DNA frag
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