基于线粒体COⅠ基因15个鸡种的DNA编码研究.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(3):587-594 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.03.020 基于线粒体CO Ⅰ基因15个鸡种的DNA编码研究 1 1 1 1 2 1 1 高玉时 ，唐修君 ，屠云洁 ，陆俊贤 ，薛茂云 ，施祖灏 ，张小燕 1 2 ( 中国农业科学院家禽研究所/农业部家禽品质监督检验测试中心，江苏扬州 225003 ； 江苏经贸职业技术学院，南京 210007) 摘要： 【目的】探明地方鸡种与引进鸡种遗传多态性特点，探讨COⅠ这一特定基因的特定区段作为DNA条形 码在识别鸡种方面的可行性和有效性。【方法】以13个中国地方鸡种和2个国外引进品种为研究对象，利用DNA 测序技术测定了线粒体细胞色素 C 氧化酶亚基Ⅰ（cytochrome c oxidaseⅠ，COⅠ）基因部分序列。【结果】选 择的这段COⅠ基因序列有38 个突变位点，15个鸡种单倍型多样度平均为0.963，核苷酸多样度平均为0.00518， 其中引进鸡种明显低于地方鸡种（除藏鸡外）；15 个鸡种品种间 Kimura 双参数遗传距离为 0.056%—0.917%，种 内遗传距离为0—0.346%，15 个鸡种的DNA 分类和形态学分类基本一致，引进鸡种与地方鸡种分歧较远。【结论】 利用线粒体细胞色素 C 氧化酶Ⅰ（COⅠ）这一特定基因的特定区段来做 DNA 条形编码的基础，进行不同鸡品种鉴 定，具有可行性和有效性。 关键词：地方鸡群体；COⅠ基因；DNA条形码；品种鉴定 Studies on the DNA Barcoding of Fifteen Chicken Breeds by mtDNA CO Ⅰ Gene 1 1 1 1 2 1 1 GAO Yu-shi , TANG Xiu-jun , TU Yun-jie , LU Jun-xian , XUE Mao-yun , SHI Zu-hao , ZHANG Xiao-yan 1 ( Institute of Poultry, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Quality Inspection Center for Poultry Products, Ministry of Agriculture, Yangzhou 225003, Jiangsu ；2Jiangsu Institute of Economic and Trade Technology, Nanjing 210007) Abstract ： 【Objective 】 The aim of the study is to prove up the heredity polymorphism of indigenous chicken breeds and import breeds, and explore the utility of CO Ⅰ gene as DNA barcoding for identifying these chicken breeds. 【Method 】 The CO Ⅰgene in fifteen chicken breeds was amplified by using PCR and sequencing. 【Result 】