崂山奶山羊分子系谱的构建及家系遗传特征分析.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(13):2796-2807 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.13.018 崂山奶山羊分子系谱的构建及家系遗传特征分析 1 1 1 1 1 2 2 1 纪志宾 , 王桂芝 , 王金凤 , 陈珊珊 , 王 勇 , 赵金山 , 程 明 , 王建民 1 2 （山东农业大学动物科技学院，山东泰安 271018 ； 青岛市畜牧兽医研究所，山东青岛 266100 ） 摘要：【目的】通过微卫星DNA 标记技术对已知系谱记录的试验群体构建分子系谱，验证崂山奶山羊与原有 系谱记录的一致性，探讨影响亲权鉴定的因素，摸清家系的遗传特征，为群体的保种和遗传管理提供科学依据。 【方法】从25 个微卫星DNA 标记中筛选出 12 个高多态性的遗传标记，对已知系谱记录的212 只崂山奶山羊，利 用Cervus vs 2.0 软件进行亲权分析，利用Pedigraph vs 2.2 软件构建试验群体的分子系谱，利用Molkin vs 3.0、 MEGA4 和GeneClass2 软件对所构建家系的遗传特征及系统发育关系进行分析。用 SPSS vs 16 软件对每个位点的 排除概率（EP）与多态信息含量（PIC）、期望杂合度（He）、观察杂合度（Ho）、等位基因数（K）等多态性参数的 相关性进行分析，分析不同位点数及信息来源对亲权鉴定准确性的影响。【结果】12 个微卫星 DNA 遗传标记的多 态信息含量均为高度多态（PIC≥0.5），平均为0.687，平均等位基因数为5.75 个，期望杂合度平均为0.730；在 父本已知的基础上进行母子亲权鉴定，置信度在95%以上的累积排除概率为0.9998，最终从80 个候选母亲、祖母 中找出了115 个后裔的母亲、祖母，发现3 个个体与原有系谱记录不相符，符合度达到98.58%，构建了2 个以父 系为基础的家系及群体分子系谱图。排除概率与PIC 相关系数最大（0.99 以上），与K 相关系数最小（0.67）。使 用8 个位点可使CEP2 达到99.73%以上。【结论】所选 12 个微卫星标记可用于崂山奶山羊试验群体的亲权鉴定及 分子系谱构建；所构建家系具有较好的遗传基础，家系间及家系内具有较高的遗传变异。 关键词：微卫星；奶山羊；亲权鉴定；分子系谱；遗传特征 Construction of Molecular Genealogy and Analysis of Family Genetic Characteristics in Laoshan Dairy Goat 1 1 1 1 1 2 JI Zhi-bin , WANG Gui-zhi , WANG Jin-feng , CHEN Shan-shan , WANG Yong , ZHAO Jin-shan , 2 1 CHENG Ming , WANG Jian-min 1 2 ( College of Animal Science and Technology, Shandong Agricu