水稻粒厚主效位点qGT8精细定位和候选基因分析.pdfVIP

中国农业科学 2015,48(24):4859-4871 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.24.001 水稻粒厚主效位点 qGT8 精细定位和候选基因分析 高方远，罗正良，任鄄胜，吴贤婷，陆贤军，苏相文，吕建群，任光俊 （四川省农业科学院作物研究所，成都 610066 ） 摘要：【目的】在已鉴定的稻谷粒长、粒宽和粒厚 QTL 的基础上，对控制粒厚的主效 QTL 进行精细定位和候 选基因分析，以解析川106B（C-106B）细长粒形的遗传基础，为进一步通过分子技术改良其产量水平提供科学依 据。【方法】以细长粒形的优质籼稻保持系川106B与籽粒较宽厚的籼稻保持系川345B（C-345B）杂交，构建包含 182 个单株的 F2 群体，采用 QTL Catographer v2.5 软件基于复合区间作图法发掘与稻谷粒形性状相关的 QTL；进 一步从 BC F 群体筛选隐性单株（稻谷厚度较薄）对粒厚主效 QTL（qGT8 ）进行精细定位，并对候选基因进行测序 3 2 和荧光定量PCR分析。分别构建 qGT8 位点携带川106B等位基因的近等基因系（NIL-gt8C-106B ）和携带川345B等位 基因的近等基因系（NIL-GT8C-345B ）并调查其稻米外观品质及产量性状。【结果】川106B 和川345B的粒长、粒宽和 粒厚表型存在显著差异。利用F2 群体检测到2个粒长QTL、3个粒宽QTL 和3个粒厚QTL，其中，位于第7染色体 区间RM21892—RM3589的粒长主效QTL（qGL7 ）可解释粒长变异的68.23%，川106B等位基因在该位点可增加粒长 0.47 mm。控制稻谷粒宽和粒厚的主效QTL（qGW8 和 qGT8 ）位于第8染色体上相同区间RM6070—RM447，分别解释 相应表型变异的 26.48%和 34.89%，增加粒宽或粒厚的等位基因均来自于川 345B。利用 1 732 个 BC F 隐性单株， 3 2 将粒厚主效位点 qGT8 精细定位在标记 SG930 和 SG950 间的 11.2 kb 区段，该区段仅包含 1 个注释基因 LOC_os08g41940（OsSPL16 ）。对该基因测序分析发现，川106B和川345B 在起始密码子ATG上游2 kb区段存在 7 个差异位点，在编码区有 5 个多态性位点，其中，川 106B 在第 3 外显子插入 2 bp（c.1006_1007 插入 CT）引起 移码突变，且位于 qGT8 的OsmiR156结合位点，推测为川106B籽粒厚度变薄、宽度变细的关键位点。实时荧光定 量PCR分析发现，qGT8 在幼穗中表达量较高，且在川106B和川345B中的表达方式相似，表达量在1—8 cm长幼 穗发育时期随幼穗发育逐渐增加，8 cm时达到最高，之后随幼穗发育逐渐降低，但2个亲本在各时期的表达水平 存在差异。近等基因系NIL-GT8C-345B 的粒厚、粒宽、千粒重、单株产量和垩白粒率显著高于NIL-gt8C-106B ，而粒长、 透明度、株高、单株有效穗数、穗长、每穗实粒数、结实率和播抽期与 NIL-gt8C-106B 相当。【结论】控制粒长的主 效 QTL（qGL7 ）位于第 7 染色体区间 RM21892—RM3589，控制粒宽和粒厚的主效 QTL 位于第 8 染色体的相同区间 RM6070—RM447。粒厚主效QTL（qGT8 ）被精细定位在仅包含GW8 的片段上，是控制粒形和产量的关键基因，但在 近等基因系中高粒重与高垩白紧密连锁，表明该位点存在高产与外观品质改良的矛盾。 关键词：水稻；粒形；粒厚；数量性状基因座位；产量；品质 Fine Mapping and Candidate Gene Analysis of qGT8, A M