大叶藻科的系统育与大叶藻居群遗传学研究.pdfVIP

大叶藻科的系统发育与大叶藻居群遗传学研究 大叶藻科的系统发育与大叶藻居群遗传学研究 摘 要 marina 大叶藻(Zostera 叶藻科在形态及分子分类方面不尽相同的研究结果，本研究基于matK、rbcL和 ITS部分序列对大叶藻科及国内5种大叶藻进行了系统发育研究，并且开展了大 叶藻不同地理居群遗传多样性的AFLP和微卫星DNA分析。主要研究结果如下： 1、比较分析了15种大叶藻的mark基因和ITS片段的核苷酸序列，结果发现胞 嘧啶(C)在2个目的片段上含量均较低。ITS基因片段检测到228处核苷酸替 换，表现出丰富的遗传多态性，marK基因片段上有249处核苷酸替换，且大部 分替换来自于第三密码子的同义替换，种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。 基于matK基因和ITS片段，利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯 法构建的系统发育树结果基本一致，明显分为4大支，大叶藻亚属、异叶藻属、 拟大叶藻亚属和虾形藻属分别构成一支。大叶藻亚属和拟大叶藻亚属的核苷酸 差异值在29．09％．35．51％，超过了屈良鹄等提出的大部分被子植物ITS属间核 苷酸差异值(9．60％．28．80％)，在分子水平上两亚属都达到了属间差异。研究 4个属。 2、运用PCR直接测序法，对采自爱尔兰、日本、韩国以及中国的大叶藻、矮大 叶藻、丛生大叶藻和红须根虾形藻叶绿体的matK、而cL和核糖体ITS的部分 片段进行测序，并结合GenBank中的宽叶大叶藻相关序列，比较分析了5种大 叶藻3个目的片段的核苷酸差异，结果发现胞嘧啶(C)在3个目的片段上含 量均较低。ITS片段检测到172处核苷酸替换，表现出丰富的遗传多态性。matK 基因片段上有52处核苷酸替换，rbcL基因片段上有20处核苷酸替换，且大部 分替换来自于第三密码子的同义替换，种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。 基于ITS、matK和rbcL 3个片段，利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝 叶斯法构建的系统发育树结果基本一致，明显分为3大支。矮大叶藻与属间3 种大叶藻的核苷酸最小差异值为19．33％，明显超过了屈良鹄等提出的大部分被 子植物ITS属间核苷酸差异值，在分子数据上达到了属的水平。基于matK和 大叶藻科的系统发育与大叶藻居群遗传学研究 rbcL基因片段拼接序列的分析结果表明：大叶藻与丛生大叶藻的分化时间约在 上新世，与宽叶大叶藻的分化时间约在上新世，与矮大叶藻的分化时间约在渐 新世，与红须根虾形藻的分化时间约在始新世。4个地区的大叶藻的ITS片段 序列完全相同，结果表明大叶藻ITS区的变异程度与地理距离无相关性，ITS 不适合用于大叶藻不同地理株间的分子系统演化。该研究进一步阐述了5种大 叶藻的系统发育关系，同时也为国内海草的分子系统发育研究提供了重要参考。 3、基于AFLP技术对6个不同地理居群的63株大叶藻进行了居群遗传学研究。 最低值出现在青岛胶南居群(O．007和0．011)。6个居群遗传相似性系数(S) 系统树可以看出，中国的3个居群聚类到一起，而天鹅湖居群与胶南居群亲缘 关系较近，可能是由于历史大海草场退化后的小片段居群发展起来的，遗传结 构也是历史海草场的一小部分；山东半岛沿岸的海洋环流很容易造成一些独立 的生境斑块，从而造成了天鹅湖居群与俚岛居群的隔离，阻碍了两个大叶藻居 群间的基因交流。地理距离是中国i韩国、日本和爱尔兰大叶藻居群问产生遗 传分化的主要原因。 ’。 4、采用4对微卫星引物对7个大叶藻居群进行了遗传多样性与遗传结构分析。 在148株植株上扩增得到57个等位基因，每个位点等位基因数约为14，大叶 显示中国的4个居群聚类到一起，可能是由于历史大海草场的遗留小片段居群 造成的；而中国、韩国、日本和爱尔兰大叶藻居群间遗传分化则主要是由于地 理距离造成的。自由交配估计结果支持海草的东亚起源说。青岛湾居群遗传多 样性较高，应该得到优先保护，并可优先作为大叶藻移植修复的材料和基因库。 关键词：大叶藻科；系统发育关系；大叶藻；种质资源；遗传多样性；序列分 析；AFLP；微卫星DNA 大叶藻科的系统发育与大叶藻居群遗传学研究