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14个肿瘤抗药基因启动子cpg岛在肝癌中的甲基化状态分析及其意义
14个肿瘤抗药性基因启动子CpG岛在肝癌中的甲基化状态分析及其意义
14个肿瘤抗药性基因启动子
CpG岛在肝癌中的甲基化状态分析及其意义
硕士研究生 丁 盛
导 师 朱景德 教授
摘 要
为探寻肿瘤抗药性相关基因的表观遗传学变化与肝癌发生、肝癌抗药性之
间的关系,我们用甲基化特异性PCR(MSP)方法在30例肝癌样本与4例正常肝组
织中,对14个抗药相关性基因的启动子CpG岛的甲基化状态进行了分析。每一
例肝癌样本包含来自同一患者的癌组织(C和表型正常的癌旁组织(N)oMSP结果
显示,11个基因(ABCG2,ATF2,B2M,DCK,OCLN,RAFT,RALBPI,SPF45,SKP2,
TP53,TOP2B)几乎在所有组织中均呈现未甲基化状态;CAT基因在正常肝组织中
未甲基化,在癌旁组织和癌组织中甲基化比例均为3.3%(1/30).CFTR基因和
GSTP1基因在正常肝组织中均未甲基化,而在癌旁组织和癌组织中甲基化比例较
高。CFTR在癌旁、癌组织的甲基化比例分别为N:50%(15/30)和C:77%(23/30)0
GSTP1为N:56.7%(1.7/30)和C:80%(24/30)。在肝癌细胞系中的MSP结果也显示
CFTR和GSTP1启动子CpG岛有很高的甲基化。RT-PCR检测GSTPI在各肝癌细胞
系的表达情况,结果与甲基化状况吻合。根据这些结果,认为CFTR和GSTP1启
动子CpG岛的高甲基化可能造成两者在转录水平上的低表达;这种表观遗传学
的变化,在肿瘤的发生和诊断中有重要意义。
关键词:肝癌,抗药性,启动子CpG岛,甲基化,甲基化特异性PCR,CFTR基
因,GSTPI基因
复旦大学上海医学院 上海市肿瘤研究所 硕士论文一t
14个肿瘤抗药性基因启动子CpG岛在肝癌中的甲基化状态分析及其意义
MethylationprofileofthepromoterCpGislandsof
fourteendrug-resistancegenesinhepatocellularcarcinoma
Graduate student ShengDing
Prof. JingdeZhu
Abstract
Toexploretherelationshipbetweentheepigeneticchangesofdrug
resistance related genes and hepatic carcinogenesis as wellas
HCC(Hepatocellularcarcinoma)drugresistance,thepromoterCpGislandsof
fourteendrugresistancegeneswereinvestigatedbyMSP (Methylation
specificPCR)methodin4normallivertissuesand30HCCpatientscases,
eachpatientcaseconsistingoftheHCCtissue(C)andtheneighboring
non-canceroustissue(N)fromthesamepatient.Anditturnedoutthateleven
genes(ABCG2,ATF2,B2M,DCK,OCLN,RAF1,RALBP1,SPF45,SKP2,
TP53,andTOP2B)showalmostunmethylatedstatusinbothHCCcasesand
normallivercontrols;TheCATismethylatedin3.3%(1130)oftheneighboring
non-canceroustissues(N)and 3.3% (1130)ofHCC tissues(C)while
unmethylatedinnormalcontrols.CFTRandGSTP1,haveaberranth
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