植物分子系统学精要.pptVIP

2．叶绿体DNA资料与植物系统学 TrnT-trnL间区 编码转运RNA的trnT和trnL基因间有一较长的基因间区(一般在600-1400bp之间)。资料显示，这一间区在cpDNA中属于分子进化速率较快的非编码区序列。Small等人(1998)在对叶绿体中的几个非编码区(包括trnT-trnL间区)和核ITS序列、Adh基因的核苷酸替代速率进行比较时发现，包括trnT-trnL间区在内的3个基因间区在PCR扩增中或不能产生足够的测序模板或已知的扩增引物不适于测序，虽然他们用克隆的方法克服了上述问题，但大大增加了实验的工作量和复杂性，这也许也是trnT-trnL间区虽然有较大的变异(在trnT-trnF区段中变异最大)和应用潜力却很少被用于系统学研究中的原因之一。 3．线粒体DNA资料与植物系统学 （1）mtDNA和cpDNA相似，为闭环双链DNA，大小约200-2000kb，但不同类群间大小差异很大，大多数被子植物为300-600kb。 （2）在mtDNA中存在许多外源序列，如，已知的mtDNA中均存在着约12kb的cpDNA序列，这些外源序列一般是无功能的假基因。 （3）在已知的植物mtDNA中都存在大的反向重复序列，其长度为1-14kb，不同类群间变化很大。 （4）由于重组、重排、重复和丢失现象十分普遍，导致结构和基因次序变化多样。 （5）在线粒体中同时存在