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文献分的析软件refviz点点通
文献分析软件RefViz 点点通
前几天在园子了看到关于 RefViz 的介绍后很感兴趣,随即下载安装试用;
用几天后,发现这是一个很有趣的软件,可以更好的帮助我们管理参考文献,并
且发现文献之间的关联性;以下将我对一些主要功能的使用体会,与DXYers 分
享一下:
一、 建立RefViz 数据库(Create View )
RefViz 可以实现与Endnote 和RM 的无缝连接,即我们可以将手头的Endnote
数据库和RM 数据库直接导入。RefViz 的PDF Help 中介绍了通过下载多种数据
库文件后建库的方法,不再赘述,这里介绍一下与参考文献管理软件之间嵌入的
方法:
在RM 或Endnote 的安装目录下,均有一个文件Configure DataViz.exe ,运
行此文件后,按照Wizard 的提示,找到RefViz 安装目录下的RefViz.exe 文件,
然后按照提示就可建立链接。(Fig1 )
Figure 1
打开RM ,可以看到工具栏中已经出现RefViz 的链接工具(Fig2 ),点击该
工具栏,RefViz 会开始自动建立相关数据库(注意此时新建的数据库自动保存在
X:\RefViz\datasets 文件夹中);
Figure 2
此外,可以通过导出RM 或Endnote 数据库为RIS 格式的文本文档,然后在
RefViz 中导入(Fig3 )
Figure 3
二、 工作视窗简介
A 为文献关联信息区,显示文献按照主题词(最初建库时,这些主题词是由RefViz
根据在文献数据库中某词的出现位置及频率自动生成的)的分类情况(在Galaxy
视图中),以及主题词之间组和后的关联性(在Matrix 视图中);
B 为关键词显示区:
b1 为一级关键词区,显示与文章关联性最强 Keywords (最初建库时,也是由
RefViz 自动生成的,这些关键词和Galaxy 视图中的关键词完全相同,是文献分
类的主要依据)
b2 为次级关键词区,与一级关键词协助进行文献分类;
b3 为描述性关键词,意义不是很大。
C 为文献基本信息区(已经把Advisor 视图关闭)
Figure 4
三、各视窗功能介绍:
在 Galaxy 视窗下,将鼠标放于某一类文献下,可以出现如图(Fig5 )所示基本
信息:
该图显示的是,第 11 类文献,总数为 82 条,Top Keywords 为 plaque,
PTCA ,atherectomy;
Figure 5
点击此类文献,则C 区和B 区的信息随之变化(Fig6 )
Figure 6
此时,进入 Matrix 视窗,虽然关键词的排序以及关联性强弱没有发生变化,但
是在第 11 类文献中出现的一级关键词均被着重显示为红色(Fig7 )。
B 区的Search 功能比较简单,不再赘述。
Figure 7
下面详细介绍一下Matrix 视窗的功能:
如图(Fig8 ),在valve 和endocarditis 的交汇点,出现文献的相关信息:相
关性0.586 ,文献计数18 条。(此相关性是如何计算出的,很神奇啊?!心内膜
炎的确和心脏瓣膜之间有重要的联系;我的个人理解,该相关性的计算依据,可
能是统计各词的出现频率,然后计算出的两个关键词同时在决定文献属性的某一
个特定部位(如文章题目)出现的概率;的确,通过这种关联,可以确立文献之
间的内在联系)
下面,我们改变关键词的排列方式(由字母顺序排列改为相似性排列),如
图(Fig9 ),可以发现横轴的关键词以其内在的相似性进行排列:ace (血管紧张
素转化酶) acei (血管紧张素转化酶抑制剂) mi (心肌梗死)captopril (一种
转化酶抑制剂)enalapril (另一种转化酶抑制剂),这几个具有内在相关性的词,
竟然都出现在一起!!(电脑也会成为一个心血管专家!)。这种排列,无疑可以为
用户提供重要的信息,可以揭示文献的研究热点和研究趋势(当然应该具备一定
的专业判断能力);比起单纯的文献检索系统,RefViz 在这一点上实在是聪明。
其它及类排列方式的组和,大家可以试一试,通过上面的
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