形象化基因组序列的分析系统.pptVIP

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  • 2016-03-13 发布于安徽
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3.2.2 GRMF的需求分析 目标: GRMF现阶段的基本需求就是以形象化互动的方式进行复杂调控子序列的构建,完成后进行参数输入,最后根据构建好的模型输出参数文件。软件最终的运行方式拟定为PC上运用软件,而且尽量保证其可扩展性,例如,必要时可发布为web应用形式。 用户特点 GRMF的可能用户为生物信息研究人员,该用户群一般对软件的界面要求不高,但是在对已筛选数据的详细深入的专门分析一个实用的软件能避免过多只是基于数字和代码的工作,而能更好的考虑其生物学意义;另一类潜在用户为从基因水平对病人进行诊断的医生,他们需要对可能的致病的调控机理进行建模,快速判断其致病机理,以便进行针对性治疗。该类用户倾向于使用界面友好的软件。 性能要求 GRMF还未与该项目上级项目的其他功能相整合,此时的功能较少,运行时计算量不大,性能表现暂无需过多考虑,只要尽量合理设计即可。 灵活性 考虑到用户群的使用习惯,GRMF应该能够在Linux和Windows下运行使用。 除此之外GRMF对硬件和接口等无特殊要求。 概要设计 GRMF 控制模块 绘图区 数据模块 图3-1 GRMF基本结构 详细设计 1、数据结构设计 状态对象:状态是GRMF的重要对象,应该包含该段序列的信息以及在GRMF中保存识别标识及一些附加信息。序列信息即序列模型;保存识别标识包括状态名,状态图形,图形颜色

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