白菜EST-SSR信息的分析及标记的建立.docVIP

白菜EST-SSR信息分析与标记的建立( 忻雅1 ，崔海瑞*1 ，卢美贞1 ，姚艳玲1，金基强1，林容杓2，崔水莲2 (1.浙江大学农业与生物技术学院原子核农业科学研究所，杭州 310029；2.忠南大学园艺系，大田305764，韩国) 摘要：对4584条白菜EST进行了搜索，共发掘474个SSR，出现的频率为10.3%，包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位，二者出现的频率基本相近，占总SSR的近83%；其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型，分别占二、三核苷酸重复类型的71.5%和37.5%。挑选其中符合引物设计的15条设计了EST-SSR引物。在合适的PCR反应体系下，以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板，对设计的EST-SSR引物进行筛选，发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对29个白菜品种进行PCR扩增，发现7对引物显示多态性，占可扩增引物的46.7%。此结果表明，根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。 关键词：EST；SSR信息；标记建立；白菜 Data mining for SSRs in ESTs and EST-SSR marker development in Chinese cabbage Xin Ya1，Cui Hairui*1，Lu Meizh