生物信息学第二章精要.pptVIP

TrEMBL (Translation of EMBL)：计算机注释的Swiss-Prot分支数据库，从EMBL库中的cDNA序列翻译得到的氨基酸序列数据库 * * * 1984年，美国国家医学研究基金会（NREF）正式启动蛋白质信息资源（Protein Information Resource, PIR）计划； 美国最主要的蛋白序列数据库; 非冗余、高质量注释、全面分类; PIR数据库按照数据的性质和注释层次分为PIR1、PIR2、PIR3和PIR4。PIR1中的序列已经验证，注释最为详尽。 * 1. 目前最主要的蛋白质分子结构数据库； 2. 1970年代建立，美国Brookhaven国家实验室维护管理; 3. 1988年，由美国RCSB(research collaboratory for structural biology)管理； 4. 以文本格式存放数据，包括原子坐标、物种来源、测定方法、提交者信息、一级结构、二级结构等； 5. PDBsum数据库：PDB注释信息综合数据库，具有检索、分析、可视化的功能。（已移至EBI） * SCOP（structural classification of protein）数据库是一个包含已有结构的蛋白质分类数据库，依据不同蛋白质的氨基酸组成的相似性及三级结构，详细描述已知结构蛋白质之间的功