人类基因组核小体定位与可变剪接调控研究.pdf

摘要 摘要 论文题目： 人类基因组核小体定位与可变剪接调控研究 作者姓名： 于双鑫 导师姓名： 孙啸 学校名称： 东南大学 核小体定位及其组蛋白修饰是影响染色质结构的两个主要因素，而染色质的结构在真核 基因转录过程扮演着重要角色。从基因转录到翻译有一个重要的生物过程，就是mRNA前 体的剪接，剪接是指将前体mRNA中不编码的内含子切除并将编码的外显子连接成mRNA 的过程；同一个基因可以有多种剪接的方式，即可变剪接，人类90％以上的基因存在可变 剪接现象。研究发现，转录和剪接在时空上高度协调，是同时进行的，这暗示可变剪接会受 到转录过程中起重要作用的染色质结构的调控，然而目前对于染色质结构调节剪接过程的细 节尚需进一步分析，因此本文使用人类CD4+T细胞的染色质结构信息数据，计算核小体定 位和组蛋白修饰在可变剪接位点周围的分布模式。 首先，经过多重去冗余得到可变剪接外显子与组成性外显子数据。结合核小体得分数据， 计算了可变剪接外显子和组成性外显子邻近区域的核小体分布模式；进一步将可变剪接依据 不同剪接方式和外显子长度分为不同类型，并计算了这些不同剪接方式的外显子邻近区域的 核小体分布模式。结果表明核小体的