建鲤肠型脂肪酸结合蛋白基因的分离及SNPs和增重的相关分析.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2013 5 , 35(5): 628―636 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2013.00628 建鲤肠型脂肪酸结合蛋白基因的分离及其SNPs 与增重的相关分析 1 1, 2 2 2 2 3 1 夏正龙 , 俞菊华 ,李红霞 , 李建林 , 唐永凯 , 任洪涛 , 朱双宁 1. , 214081; 2. , , 214081; 3. , 471003 文章采用 PCR 方法从建鲤 ( Cyprinus carpio var. jian) 基因组分离到 2 个肠型脂肪酸结合蛋白基因 (Fatty acid binding protein 2, FABP2), ORF 长度均为399 bp, 相似度为92.2%, 分别记为jlFABP2a 、jlFABP2b , 和 斑马鱼 (Danio rerio) FABP2 ORF 的相似度分别为88.0%和90.5% 。jlFABP2s 基因结构与FABPs 家族其他成员 一致, 由4 个外显子和3 个内含子组成, 2a 和2b 间内含子序列和长度差异明显。系统树显示这2 个基因对应斑 马鱼的 1 个FABP2 基因, 和鲤鱼染色体数是斑马鱼的 2 倍一致。实时荧光定量 PCR 结果显示, jlFABP2a 、2b 在建鲤肠中的表达量极显著高于脑、肝脏、肌肉、肾脏、心脏、性腺等其他组织 (P0.01), 且2a 表达量显著 ( 雄 鱼, P0.05) 或极显著 (雌鱼, P0.01) 高于2b, 但在其他组织则2b 表达量稍高, 暗示2a 为肠特异性表达, 2b 则 为广谱表达。通过比对8 尾建鲤的2a 和2b 基因序列, 在2a 和2b 上分别找到 12 个和4 个SNP, 均位于内含子 上。使用PCR-RFLP 法检测jlFABP2a 上4 个SNP 位点I1-A15G 、I1-A99G 、I2-C487T 和I3-A27T 在建鲤选育 群体中的基因型分布, 并进行了基因型与个体增重的关联分析, 结果表明, 4 个位点与雌、雄成鱼阶段增重分别 有极显著或显著相关。同时考虑4 个位点的基因型与增重的关系, 结果基因型AGGGCCXX 和AGGGXXAT 的 个体平均增重比其他个体快 15%, 这两种基因型个体在选育群中占了 9%, 具有较大的选育空间, 可用于建鲤 分子育种计划中。 建鲤; 肠型脂肪酸结合蛋白; 组织表达; 单核苷酸多态性; SNP-增重相关分析 Sequences analysis of jlFABP2 and the correlation between poly- morphisms and body weight gain in Cyprinus carpio var. jian 1 1,2 2 2 2 XIA Zheng-Long , YU Ju-Hua , LI Hong-Xia , LI Jian-Lin , TANG Yong-Kai , REN 3 1 Hong-Tao , ZHU Shuang-Ning 1. Wuxi Fishery College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081, China; 收稿日期: 2012−09−23; 修回日期: 2012−11−12 基金项目: (