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利用目标区段剩余杂合系进行大豆开花期QTL的验证和精细定位.pdf
2010 年 第 55 卷 第 4-5 期：332 ~ 341 《中国科学 》杂志社
SCIENCE CHINA PRESS
论 文
利用目标区段剩余杂合系进行大豆开花期 QTL 的验证和
精细定位
① ② ① ①*
苏成付 , 卢为国 , 赵团结 , 盖钧镒
① 南京农业大学大豆研究所, 国家大豆改良中心, 作物遗传与种质创新国家重点实验室, 南京 210095;
② 河南省农业科学院经济作物研究所, 郑州 450002
* 联系人, E-mail: sri@
2009-07-09 收稿, 2009-09-21 接受
国家重点基础研究发展计划(编号: 2006CB1017 和 2009CB1184) 、国家高技术研究发展计划(编号: 2006AA100104)、国家自然科学基金(批
准号:、国家科技支撑计划(编号: 2006BAD13B05-7)以及高等学校创新引智计划(编号: B08025)资助项目
摘要 以成熟期Ⅴ组的Essex 为母本, Ⅱ 组的ZDD2315 为父本和轮回亲本, 创建114 个单 关键词
株的BC1F1 群体; 采用250 个SSR 标记, 通过MAPMAKER3.0 构建遗传图谱, 覆盖大豆基 大豆
因组2963.5 cM. 采用WinQTLCart 2.5, IciMapping 2.0, MapQTL 5.0 以及QTLnetwork 2.0 回交家系
剩余杂合系(RHL)
共4 种软件的6 种遗传统计模型对BC1F3 家系的开花期表型数据, 共检测到9 个控制开花
SSR 标记
期的QTL. 6 个能被至少两种模型检测到; 3 个只被一种模型检测到, 其中Flwdt7 定位在C2
开花期
连锁群的Satt643 和Sat_213 之间, 置信距33.8 cM, 贡献率11.0%. 为验证此结果, 从BC1F5 QTL 精细定位
家系中选择该区间附近标记杂合单株, 经自交建立5 个剩余杂合系(RHL), 分别在7 个位点
上有分离. 在检测遗传背景相对一致后将分离位点相同的合并, 采用 JoinMap®3.0 构建该
区段子图谱. 用QTLnetwork 2.0 NWIM 将Flwdt7 定位在邻区间Satt277~Satt489, 离两侧标
记的距离分别为1.40 和0.45 cM, 置信距缩短为2.7 cM, 贡献率上升为36.8%. 再用RHL
标记等位变异分组差异显著性分析和目标区间近等基因系分析等方法验证了该结果. 多种
模型全基因组QTL 初扫描基础上的目标区段剩余杂合系定位是一种有效的精细定位策略.
大量 QTL 定位研究表明, 建立初级作图群体进 结果失真 . 数量性状初定位的分辨率有限, 置信区间
行 QTL 定位的结果, 因数据准确性、标记密度、遗 比较大, 难免会出现偏差 . 因而尚有待验证, 有的还
传背景复杂性、定位所用遗传模型的适合性等原因 , 需作进一步精细定位 .
常有较大波动, 属于初定位, 有待验证并提高其精确 生育期是大豆最重要的生态性状 . 适应不同地
性 . QTL 定位准确性, 除决定于图谱和表型数据准确 区、不同播季的大
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