水稻茸毛基因GL6的遗传学分析与精细定位.pdfVIP

2013 年 第 58 卷 第 11 期： 1027 ~ 1035 《中国科学》杂志社 论 文 SCIENCE CHINA PRESS 水稻茸毛基因GL6 的遗传学分析与精细定位 ①② ①② ①② ①② ①②* ①②* 曾跃辉 , 朱永生 , 连玲 , 谢鸿光 , 张建福 , 谢华安 ① 福建省农业科学院水稻研究所, 福州 350019; ② 福州( 国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/农业部华南杂交水稻种质创新与分子育 种重点实验室/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/水稻国家工程实验室/杂交水稻国家重点实验室华南 基地, 福州 350003 * 联系人, E-mail: jianfzhang@163.com; huaanxie@ 2012-12-07 收稿, 2013-01-21 接受 国家重点基础研究发展计划(2012CB723003)、国家高技术研究发展计划(2010AA101801, 2010AA101804)和福建省农业科学院科技创新 团队建设项目(STIF-Y04)资助 摘要 叶片表面茸毛是水稻形态学特征上的一个重要农艺性状, 对水稻的生长及生理特性有 关键词 着重要的影响. 应用叶片具有茸毛特征的水稻品种 75-1-127, 无茸毛水稻品种明恢 63, 光身 水稻 稻品种Lemont, 9311 分别杂交产生F1 及F1 自交产生的F2 群体对水稻茸毛基因进行遗传学分 茸毛基因GL6 析, 结果表明, 水稻茸毛性状为一对细胞核基因控制的显性性状. 应用75-1-127/ 明恢63 的F2 遗传学分析 精细定位 隐性分离群体, 结合分离群体分析法(BSA)和隐性群体分析法(RCA), 并通过 Mapmaker3.0/ MapDraw 软件分析, 将水稻茸毛基因 GL6 初步定位在水稻第6 号染色体上, 位于SSR 标记 RM20491 和RM20547 之间, 且两标记与该茸毛基因的相对遗传距离分别为7.2 和2.2 cM. 进 一步构建大的F2 分离群体并同时挖掘新的SSR 标记及插入缺失InDel 标记用于茸毛基因GL6 的精细定位, 将茸毛基因GL6 精细定位在插入缺失标记InDel-106 和InDel-115 之间, 且两标 记与该茸毛基因的相对遗传距离分别为0.3 和0.1 cM, 结合GeneBank 数据库分析, 在该精细 定位区域内, 对应粳稻日本晴和籼稻9311 的物理距离分别为79 和116.82 kb, 分别注释有7 个和8 个预测基因, 为进一步的基因克隆和功能研究奠定了基础. 光身稻又名“光壳稻”或“光叶稻”, 其茎秆、叶片、 均具有较好的亲和性[7,8]. 大部分普通栽培稻中的光 叶鞘、叶脉及谷粒乃至整个水稻植株都是无毛的、光 身稻是籼粳亚种分化不够彻底的一种具有爪哇稻特 滑的[1,2], 在收割和加工时无粉尘, 对人的皮肤没有 性的粳型[6], 地域分布及遗传分化都比较复杂, 与粳 损害, 适合机械化的生产和农业工人的操作[3], 同时 稻及籼稻之间有着非常好的亲和性, 因此, 可以通过 也不会对环境造成污染, 因此又称之为“环保水稻”, 光身稻接线搭桥, 利用粳稻和籼稻两亚种之间杂交 主要分布在美国、非洲和我国云贵高原等地, 是目前 新品种优势, 选育出不仅具有光身稻品质优势, 并且 美国和非洲等大部分地区主要栽培的品种类型[4].