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第二章 DNA的复制 第一节 DNA的半保留复制 第二节 复制的起点、方向和速度 第三节 复制的几种主要方式 DNA复制的半不连续性 第四节 DNA复制的酶学 第五节 DNA复制的起始,延伸和终止 第六节 真核生物的DNA复制 第一节 DNA的半保留复制 DNA的复制机制: 1954年,Watson和Crick最早提出DNA的半保留复制, 即在复制过程中双链DNA氢键断裂,双螺旋解旋并被分开,每一条链分别为模板合成其互补链, 产生双链。由于新生的互补链与母链构成子代DNA分子,所以称为DNA的半保留复制 (semi-conservative replication)。 3、DNA半保留复制的生物学意义: DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。 第二节 复制的起点、方向和速度 一、 复制子和复制起点 2. 复制起始点 复制时,DNA要解开双链分别进行,打开双螺旋的位置就是一段特定的DNA序列,叫做复制起始点,常用ori或O表示。 复制起始点(ori)有特定的结构特点,便于特定的酶来识别,起始 DNA的复制。 一个复制子只含有一个复制起点,但可以以双向或单向进行复制。 特点: 所有基因组DNA的复制原点都处于双螺旋结构内部,就是线状DNA复制原点也不在末端 。 原核生物的复制起始点的结构、特点 p44 Eg. 大肠杆菌的复制起始点(oriC)的结构特征 ① (A+T)含量占56%; ②在oriC中,除了碱基序列高度保守之外,而在某些部分虽然碱基种类不十分保守,但碱基数目却是保守的; ③在oriC中,有9个~14个GATe位点(大肠杆菌有11个),其中有8个GATe位点在6种oriC中的位置完全保守; ④有四个高度保守的DnaA识别位点R1, R2, R3, R4。 大肠杆菌复制起点的核苷酸序列特征 二、复制方向和复制叉 复制起点的性质所决定DNA复制从特定位置开始,大多数双向进行,也有一些单向的,或以不对称的双向方式进行的。 三、复制速度 速度:原核生物复制 速度快,平均约800bp/s,单复制子,约20min一代,40min复制一次; 真核生物复制速度慢,复制速度50bp/s,多复制子,约6-8h完成一次复制。 DNA复制主要是向两个方向等速进行。 复制眼:DNA正在复制的部分在电镜下观察起来象一只眼睛,称为复制眼(replication eye)。 θ型结构(θ structure )指正在复制的环形DNA由于复制眼的存在而呈θ型,称为θ型结构。例如:大肠杆菌DNA。 结果 释放出的新合成的单链; 先复制成双链DNA,被酶切割成单位长度后,再形成环状双链DNA分子; 释放出的新合成的单链DNA,先被酶切割成单位长度形成单链环状DNA分子后再复制成双链环状DNA分子。 滚环复制适用于双链环状分子复制单链环状分子:噬菌体ф×174DNA(双链环状)就是利用这种方式产生其后代的。 滚环复制用于基因扩增:丝心蛋白 第四节 原核生物和真核生物DNA复制的特点 DNA聚合酶和聚合反应 p47 三种DNA聚合酶的结构和功能 DNA连接酶 与DNA几何学性质相关的酶 p 44 一、 DNA的聚合酶 1 DNA聚合酶的发现与种类: DNA聚合酶是DNA合成中起主要作用的酶, 1957年, Arthur kornberg首次发现DNA聚合酶I ,后来又相继发现了DNA聚合酶Ⅱ 、Ⅲ,最近又发现了IV和V(功能尚不详) 。 前三种 DNA聚合酶都具有催化DNA合成的共同特点,同时具有其他酶活性。 酶活性简介: (1)5’-3’ DNA聚合酶活性: (2)3‘→5’外切核酸酶活性 (3)5‘→3’外切核酸酶活性 (4)核酸内切酶活性 : DNA聚合酶I (DNA Polymerase I,Pol I) : DNAPolⅠ在空间结构上近似球体。在酶的纵轴上有一个约20A的深沟(cleft),带有正电荷,这是该酶的活性中心位置,在此位置上至少有6个结合位点: [1]模板DNA结合位点; [2]DNA生长链或引物结合位点; [3]引物末端结合位点,用于结合专一引物或DNA生长链的 3′-OH; [4]脱氧核苷三磷酸结合位点; [5]5′→3′外切酶活性位点,用以结合生长链前方的5 ′ -端脱氧核苷酸并切除之; [6]3′ →5′外切酶活性位点,用以结合和切除生长链上未配对的3-端核苷酸。 2. 切口平移(Nick Translation): 应用:同位素标记 四、 DNA连接酶(DNA Ligase) DNA连接酶可以使切刻接合,即催化单链
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