节基因的表达与调控概述.pptVIP

第三章 基因和基因组 §3.3 基因的表达与调控 一、原核生物基因的表达调控 与调控相关的基因 ①启动基因—— 操纵基因的临近，能发出信号，开始合成mRNA;不转录 ②调节基因—— 基因产物（蛋白质或RNA）调控其他基因的表达 ③操纵基因—— 位于结构基因的临近，不转录但调控结构基因的转录速度 ④结构基因—— 细胞中的基本看家蛋白质，如代谢酶类、转运蛋白和骨架蛋白等 大肠杆菌乳糖操纵子 二、真核生物基因的表达与调控 * * 背景介绍 大肠杆菌通常利用葡萄糖作为碳源，通常情况下环境中乳糖极少，降解乳糖的酶不被合成，其实质是乳糖降解酶基因不表达。 阻遏蛋白 乳糖酶基因 操纵基因 结构基因 半乳糖苷酶 半乳糖苷转乙酰酶 半乳糖苷透性酶 操纵基因——基因合成的开关 调节基因 关——阻遏蛋白阻挡操纵基因，结构基因不表达 诱导物（乳糖） 开——诱导物阻止阻遏蛋白功能发挥。 mRNA 酶蛋白 阻遏蛋白 操纵基因 结构基因 调节基因 mRNA 酶蛋白 阻遏蛋白不能与操纵基因结合，所以结构基因表达。 酶代谢产物一旦大量积累 阻遏蛋白被产物激活，结构基因不表达。 原核生物基因主要是转录控制 不需要，产物阻遏常规酶的合成 真核细胞基因组的复杂性： e.g., human genome: 约30亿 bp DNA；包含约3万个基因；95％的非编码DNA序列（功能？）； 一生合成总蛋白质的种类约10万种，但在一个典型的分化细胞中合成约5000种蛋白质；如何调控？ 人类基因组计划（HGP） 功能基因组学：基因及其产物（蛋白质）的功能。 不同组织器官中表达不同的蛋白质组 （2D-gel） 从DNA到蛋白质的可能的调控步骤 真核基因表达的多级控制 主要调控水平： *－转录水平调控（transcriptional control） *－转录后水平调控（post-transcriptional control） RNA加工水平调控（RNA processing control） 翻译水平调控（translational control） －蛋白质的翻译后修饰（post-translational modification） （ 一）转录水平的调控 基本概念： 事件：DNA/protein, protein/protein 相互作用； 顺式作用元件（cis-acting element）：与转录调控蛋白特异 结合的DNA序列； 反式作用因子（trans-acting factor）：与特定DNA序列结 合的调控蛋白因子； “模体”结构（motif）：蛋白质中的小结构域，由一小段保 守的氨基酸构成，用以识别特定的DNA序列或其他蛋白质； e.g., helix-turn-helix, zinc-finger, ?-sheet, leucin-zip, etc. 真核基因的结构 基因远端的调控元件 — 增强子（enhancer） 特点： 距离基因的起始点较远 位置不定：上游、下游、内含子内部 方向性：正反方向均有作用 作用机制： 间隔DNA可以形成环状 通过与enhancer结合的特异因子起作用 染色质构型的改变（重塑） 基因远端的增强子促进转录复合体的装配 DNA甲基化抑制基因转录的机制： – 干扰转录因子对DNA元件的识别和结合 – 将转录因子的DNA识别序列转变为阻抑物的识别序列 – DNA甲基化有利于招募染色质重塑或修饰因子 DNA甲基化的普遍性： 脊椎动物（包括哺乳类和人）、植物中普遍存在；低等 生物（果蝇、酵母等）中未发现。 DNA甲基化抑制基因转录的机制 基因组印记（genomic imprinting）和甲基化 现象： 在二倍体动物中，有些基因（～100个）的表达，依赖于其是来自于父本还是母本染色体，如同印上了“印记”； 印记是由DNA甲基化标记来实现区分的；印记的基因在受精后不受“去甲基化波”的影响，从而“记忆”住了亲本所标记的表达方式（阻抑或促进）。e.g., 鼠的 Igf2 基因。 这是DNA的“状态”，而不是其序列决定可遗传性状的证据（表观遗传）。 鼠中基因“印记”的传递方式 转录后调控的步骤和方式 基因的转录后调控 （post-transcriptional control ） （二）RNA加工水平的调控 (RNA processing) 1, 选择性剪接（alternative splicing） 以区别 组成型剪接