几种分子遗传标记技术概述.ppt

分子遗传标记概述 20世纪70年代以来，随着分子生物学的发展，相继建立了RFLP、RAPD、AFLP、SNP、SSCP等分子遗传标记检测技术。 分子遗传标记（Molecular Genetic Markers）是以个体遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。 多为共显性 在生物发育的不同阶段，不同组织的 DNA 都可用于标记分析 表现为中性，不影响目标性状的表达 基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的 检测手段简单快捷，易于实现自动化 分子遗传标记的分类 主要的分子遗传标记 原理：用限制性内切酶切割基因组DNA后，基因组DNA在检测区域内发生了重排、插入、缺失或点突变，导致酶切位点发生改变，从而形成了大小不等、数量不同的酶切片段，当这些片段通过凝胶电泳时就形成不同的带，用分子探针杂交并利用放射自显影成像时，不同程度的RFLP谱带表示其多态性。 RFLP的优点 RFLP的应用 2、AFLP?(Amplified?Restriction?Fragment?Polymorphism)  扩增片段长度多态性 AFLP的优点 AFLP的应用 3、SSCP（Single Strand Conformation Polymorphism) 单链构象多态性 单链构象多态性检测是一种基于单链DNA构象差别来检测点突变的方法。 SSCP的应用 4、RAPD（Random amplified polymorphism DNA） 随机扩增多态性DNA 原理：以基因组DNA为模板， 以单个人工合成的随机多态核苷酸序列（通常为10 个碱基对）为引物，在Taq 酶作用下，进行PCR 扩增。扩增产物经凝胶电泳分离、溴化乙锭染色后，在紫外透视仪上检测多态性。扩增产物的多态性反映了基因组的多态性。 RAPD的优点 引物可随机合成和随机选定，长度一般为9- 10 bp； 不同生物基因组可以共用一套引物； 退火温度低，一般为36℃，允许适当的错配； 每个RAPD 反应中，仅加单个引物，就可通过引物和模板DNA 随机配对实现扩增，扩增无特异性； RAPD 分析所需的DNA 样品量极少。 5、TRS（Tandem Repeated Sequence) 串联重复序列标记 微卫星DNA又称简单序列重复(Sample Sequence Repeats，SSR)，广泛存在于真核生物基因组中，以1~6个碱基为核心序列，首尾相连组成的串联重复序列。 原理：每个微卫星两侧一般是相对保守的单拷贝序列，据此可设计专一引物，通过PCR技术扩增微卫星片段，扩增产物经凝胶电泳分离后，不同个体间因核心序列的重复次数不同而产生DNA多态性。 单拷贝序列在单倍体基因组中只出现一次，但储存了巨大的遗传信息，可以编码各种不同功能的蛋白质，因此对这些序列的研究有特别重要的意义。 6、SNP（Single Nucleotide Polymorphism) 单核苷酸多态性标记 概念：SNP指染色体上某个位点单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失或插入等。 特性： 高密度； 代表性； 易实现自动化分析，标记为双等位标记。 SNP的应用 人类基因单体型图的绘制 描述人类常见的遗传多态性模式和染色体上具有成组紧密关联SNPs的区域，用来绘制人类基因单体型图。 SNP与疾病易感基因的相关性分析 随着大量代谢通路和上百万SNPs的确认，SNP作为新一代遗传标记在人类疾病研究中显示出极高的潜在价值。 SNP研究与药物设计 随着SNP的研究与药物基因组学的结合，根据特定的基因型来设计药物将成为可能。 7、mtDNA标记 mtDNA（Mitochondrial DNA）：线粒体DNA 母系遗传、缺乏重组及进化速率快等 动物单亲（母亲）亲缘鉴定、种质资源的起源、分子进化和分类的研究 Lipin家族的研究进展 几种分子遗传标记技术简介 动物遗传标记课程作业 动物遗传标记课程作业 分子遗传标记概述 1 主要分子标记技术 4 分子遗传标记优越性 2 分子遗传标记分类 3 几种分子标记的比较 5 动物遗传标记课程作业 动物遗传标记课程作业 分子遗传标记的优越性 动物遗传标记课程作业 Southern杂交为核心的分子标记，如RFLP DNA芯片技术为基础分子标记，如SNP PCR技术为基础的分子标记，如RAPD PCR与酶切技术结合的分子标记，如AFLP 分子