生物信息学简介分析.ppt

 生物信息学 目 录 生物信息学概念 生物信息学的研究意义 生物信息学的研究内容 生物信息学的生物学基础 生物信息学的发展趋势 一、生物信息学的概念 采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸和蛋白质等）的收集、加工、储存、解释的一门科学。  计算机学、计算机网络 二、生物信息学研究意义 认识生物本质 了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息，阐明生物信息之间的关系。 改变生物学的研究方式 改变传统研究方式，引进现代信息学方法 在医学上的重要意义 为疾病的诊断和治疗提供依据 为设计新药提供依据 三、生物信息学研究主要内容 序列比对 蛋白质结构比对和结构预测 基因识别分析 分子进化和比较基因组学 序列重叠群装配 遗传密码 药物设计 基因和蛋白质芯片 1.基因识别分析 （1）基因：具有遗传效应的DNA片段 （2）基因识别： 目的：识别全部人类的基因 包括：识别基因组编码区 识别基因结构 （3）基因识别分析 基本问题：是给定基因组序列后，正确识别基因的范围和在基因组序列中的精确位置。 2.基因组学和蛋白组学的研究 （1）基因组：包含细胞或生物体全套遗传信息的全部遗传物质 （2）基因组学：有关基因组的研究。 实质：分析和解读核酸序列中所表达的结构与功能的生物信息。 （3）蛋白组学：在一定条件下某一基因组蛋白质表达的数量类型。 3.生物芯片的研究 （1）基因和蛋白质芯片 基因芯片：专门用于核酸检测的生物芯片，而是目前运用最广泛的微列阵芯片。 蛋白质芯片：一种新型的生物芯片，由固定于不同种类支持介质上的蛋白微列阵组成的。 （2）生物芯片技术 包括： 芯片方阵的构建 样品的制备 生物反应 信号检测测及分析等环节 4.蛋白质结构预测 蛋白质结构预测成为了了解蛋白质功能的重要途径 蛋白质结构预测可分为： 二级结构预测（可归为模板识别问题和空间结构预测） 三级结构预测 5.生物信息数据库 由于生物信息学不断产生大量性的生物学信息，所以对这些信息的储存、检索、比较分析必须借助于计算机数据库技术。 特点： （1）种类不断增加 （2）结构日益复杂 （3）使用日趋便捷 四、生物信息学的生物学基础 生物信息学主要研究两种信息载体 DNA分子 蛋白质分子 (1)遗传信息的载体——DNA 基本组成单位 种类： (A)腺嘌呤脱氧核苷酸 (T)胸腺嘧啶脱氧核苷酸 (G)鸟嘌呤脱氧核苷酸 (C)胞嘧啶脱氧核苷酸 （2）蛋白质 基因控制蛋白质的合成 遗传信息的传递和控制，根据中心法则，即从DNA到RNA到Pro的全过程。 基因的表达与调控的实质，即： 四、生物信息学的发展趋势 随着计算机技术的进步, 针对不同的科研需要构建的网络资源平台、生物分析软件应运而生, 为生物学的发展提供了新技术的支持。生物信息学的研究进展表明, 生物技术日益需要信息技术, 并且越来越依赖信息技术现在许多信息技术手段, 尤其是数据挖掘技术如何更紧密更实际地与生物信息学的研究相结合仍然处于不断的探索之中。 * * ? ? ? ? 医学 生物学、 分子生物学 生物信息学 数学、 统计学 生物信息学是一交叉性学科，它位于生物、医学、计算机、数学等多个领域的交叉点上 遗传信息的载体主要是DNA 控制生物体性状的基因是一系列DNA片段 生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达 脱氧 核糖 碱基 磷酸 A G C T DNA RNA 蛋白 质 转录 翻译 T C A T G A T T A A G T A C A A A T A G T A C A A A T T C A T G A T T A 转录过程 A G T A C A A A T U C A U G U U U A mRNA 细胞质 细胞核 核孔 A—C—T—G—G—A—T— C—T T—G—A—C—C—T—A— G—A A—C—U—G—G—A—U—C—U mRNA tRNA U–G–A C–C–U A–G–A 苏氨酸——甘氨酸——丝氨酸 转录 翻译 蛋白质 DNA 肽键 肽键 * * *