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ubuntu-server搭建MPI并行计算环境.pdf
目录
MPICH2 集群搭建--Ubuntu 9.042
1、背景及前期配置2
1.1、文档目的2
1.2、一些定义2
1.3、系统结构说明2
2、并行环境搭建3
2.1 配置主机(node1)3
2.2 安装NFS 文件系统3
2.3 挂载共享目录5
2.4 安装SSH 服务5
2.5 安装MPICH2 6
2.6 配置环境变量6
2.7 MPD 配置7
3、并行环境搭建——客户端配置8
3.1 安装NFS 客户端与SSH 8
3.2 测试mpd 9
3.3MPICH2 的使用9
4.致谢11
5、参考资料11
1 / 11
【原创】MPICH2 集群搭建--Ubuntu 9.04
By LR
1、背景及前期配置
1.1、文档目的
本文档旨在为并行环境的搭建人员、系统管理员以及需要使用MPICH2 环境
的用户提供一个参考。
1.2、一些定义
MPI :Message Passing Interface ,并行数据标准
NFS :Network File System ,网络文件系统。
SSH :Secure Shell Client
GCC :GNU Compiler Collection,GNU 编译器套装
XManager :一个免费的,带有X 协议的Telnet/SSH 客户端
1.3、系统结构说明
本文档所搭建的系统物理结构如下图所示,文中的说明均按照此结构进行。
2 / 11
NOTES :在给每个节点安装系统发的时候,请提供一个统一的用户名及密码,
方便之后的配置,本文档使用cluster 为统一用户名。 (本文仅使用两台电脑作
为演示,Node1 和Node2 ,使用Node1 作为主节点,其他的以此可自行扩展)。
同时为每一个节点做好网络配置。过程如下:
配置IP :
sudo vi /etc/network/interfaces
配置静态IP 地址,要编辑的内容如下:
auto eth0 ## 自动启用第一块网卡
ifconf eth0 inet static
address 192.168.0. 11 ##IP 地址
netmask ##子网掩码
gateway ## 网关
然后配置DNS 服务器:
sudo gedit /etc/resolv.conf
nameserver #添加或者更改这一行 (根据自己的DNS )
重启网络服务:
sudo /etc/init.d/networking restart
2、并行环境搭建
2.1 配置主机 (node1)
sudo vi /etc/hosts:
图1 配置主机名
注意:对于环回地址,请配置为localhost 而不是主机名
2.2 安装NFS 文件系统
在主机和从机都需要执行以下命令。
3 / 11
终端窗口输入命令:
sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common
安装完成之后,可以使用在终端窗口下输入:
sudo mkdir /mirror
该命令会在根目录下创建一个/mirror 的目录,该目录就是今后所有节点共享的目
录,稍后我们会将MPICH2 安装在该目录下,同时可以设置所有节点已启动便
挂在该目录,这样,我们可以只在主节点上安装一次MPICH 即可(本文采用的是
只在主节点安装一次的方法) 。
接下来需要修改该目录所属的用户及组
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