ubuntu-server搭建MPI并行计算环境.pdfVIP

目录 MPICH2 集群搭建--Ubuntu 9.042 1、背景及前期配置2 1.1、文档目的2 1.2、一些定义2 1.3、系统结构说明2 2、并行环境搭建3 2.1 配置主机（node1）3 2.2 安装NFS 文件系统3 2.3 挂载共享目录5 2.4 安装SSH 服务5 2.5 安装MPICH2 6 2.6 配置环境变量6 2.7 MPD 配置7 3、并行环境搭建——客户端配置8 3.1 安装NFS 客户端与SSH 8 3.2 测试mpd 9 3.3MPICH2 的使用9 4.致谢11 5、参考资料11 1 / 11 【原创】MPICH2 集群搭建--Ubuntu 9.04 By LR 1、背景及前期配置 1.1、文档目的 本文档旨在为并行环境的搭建人员、系统管理员以及需要使用MPICH2 环境 的用户提供一个参考。 1.2、一些定义 MPI ：Message Passing Interface ，并行数据标准 NFS ：Network File System ，网络文件系统。 SSH ：Secure Shell Client GCC ：GNU Compiler Collection，GNU 编译器套装 XManager ：一个免费的，带有X 协议的Telnet/SSH 客户端 1.3、系统结构说明 本文档所搭建的系统物理结构如下图所示，文中的说明均按照此结构进行。 2 / 11 NOTES ：在给每个节点安装系统发的时候，请提供一个统一的用户名及密码， 方便之后的配置，本文档使用cluster 为统一用户名。 （本文仅使用两台电脑作 为演示，Node1 和Node2 ，使用Node1 作为主节点，其他的以此可自行扩展）。 同时为每一个节点做好网络配置。过程如下： 配置IP ： sudo vi /etc/network/interfaces 配置静态IP 地址，要编辑的内容如下： auto eth0 ## 自动启用第一块网卡 ifconf eth0 inet static address 192.168.0. 11 ##IP 地址 netmask ##子网掩码 gateway ## 网关 然后配置DNS 服务器： sudo gedit /etc/resolv.conf nameserver #添加或者更改这一行 （根据自己的DNS ） 重启网络服务： sudo /etc/init.d/networking restart 2、并行环境搭建 2.1 配置主机 （node1） sudo vi /etc/hosts: 图1 配置主机名 注意：对于环回地址，请配置为localhost 而不是主机名 2.2 安装NFS 文件系统 在主机和从机都需要执行以下命令。 3 / 11 终端窗口输入命令： sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common 安装完成之后，可以使用在终端窗口下输入： sudo mkdir /mirror 该命令会在根目录下创建一个/mirror 的目录，该目录就是今后所有节点共享的目 录，稍后我们会将MPICH2 安装在该目录下，同时可以设置所有节点已启动便 挂在该目录，这样，我们可以只在主节点上安装一次MPICH 即可(本文采用的是 只在主节点安装一次的方法) 。 接下来需要修改该目录所属的用户及组