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可以在 NCBI 的 BLAST 服务器上对 TETHIS21 序列进行相似性比较。 选定序列,或者从 EDIT 菜单中选择 Select All。 从网络检索菜单(NET SEARCH MENU),选择 BLAST 查找。BLAST 对话框就会出现。 程序默认为 blastn,数据库默认是 nr,参数转换请参照帮助。单击 OK 开始查找。 寻找结果显示为两部分。上边的部分是按可能性的顺序显示检索到的序列的名字,下面的部分显示上面部分选定序列与提交序列(上边序列)比较的具体结果。 BLAST 结果窗最上边的 3 钮被用来打开,或者保存检索到的序列,或者让你了解更多的有关信息。 选定序列的一部分。如果你是希望全选序列,从EDIT MENU 菜单,选择Select All。 从GOODIES MENU 菜单,选DNA Statistics,就会出现下面的窗口,显示序列信息。 碱基总数、A/T/G/C百分比等 这功能能帮助你校正测序序列中的错读。 选定序列。 单击校对发音图标(序列窗口底部张开的嘴),或者从SPEECH MENU,选Proof-Read Sequence。电子的音声就会开始朗读所选的序列。? 要改变音声read-back的速度,从SPEECH MENU菜单,选择Faster or Slower。 要停止校读,点击图标(手),或者从SPEECH MENU菜单,选择Proof-Read Sequence。 首先创建一个用于保存的序列。从文件菜单,选New中的New DNA,或者New Protein。 将序列写入出现的窗口。 如果你输入非法字符,计算机会发出警告。 然后,我们将序列保存为EditSeq文件: 从文件菜单,选Save。 选定保存位置。 给序列命名。 单击保存则可。 以GenBank或GCG格式保存序列: 以FASTA格式保存序列: 帮助查找和注释DNA序列中的基因和其他特征序列,包括ORFs,剪接位点,转录因子结合位点,重复序列和酶切位点等。通过应用“methods”到序列,序列的feature可以以图形的形式展示出来。你可以在序列上注释任何你发现的feature。和其它的应用程序一样,GeneQuest也提供整合的BLAST和Entrez寻找功能。 打开已有分析文件 能直接打开DNASTAR,ABI和GenBank文件。其他格式的序列文 件也可以使用EditSeq改为DNASTAR格式 GeneQuest的DNA分析方法 用分析方法操作 方法参数改变 结果展示优化 Feature注释 BLAST检索 Entrez Database检索 GeneQuest的其他特点 保存分析文件 DNA star 组件 2、GeneQuest 酶切图谱分析,克隆实验设计,分析及处理实验结果等。同时还具有绘制质粒图谱的功能及BLAST查找功能。 新酶切图制作 过滤器类型 自己定义的可以使用的酶切位点的集合 应用频率过滤器 应用手动过滤器 使用Must Cut Here/Don’t Cut Here调色板工具 是另一种酶切位点过滤限制方法 酶信息显示 环形展示 ORF图 显示择选

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