微生物进化系统发育和分类.ppt

噬菌体分型 噬菌体对宿主的感染和裂解作用具有高度的特异性。同一种噬菌体只能感染和裂解某种细菌，甚至只裂解种内的某些菌株。所以，根据噬菌体的宿主范围可将细菌分为不同的噬菌型和利用噬菌体裂解作用的特异性进行细菌鉴定。 通过氨基酸顺序判断细菌间的亲缘关系 第五节　微生物的快速鉴定和自动化分析技术 近20多年来，随着微电子、计算机、分子生物学、物理、化学等先进技术向微生物学的渗透和多学科的交叉，这方面已取得了突破性进展，许多快速、准确、敏感、简易、自动化的方法技术，不仅在微生物鉴定中广为使用，而且在微生物学的其它方面也被采用，推动了微生物学的迅速发展。 一、微量多项试验鉴定系统 根据微生物生理生化特征鉴定的结果，而进行的数码分类鉴定（简易诊检技术，或数码分类鉴定法）。 它是针对微生物的生理生化特征，配制各种培养基、反应底物、试剂等，分别微量(约0.1ml)加入各个分隔室中(或用小圆纸片吸收)，冷冻干燥脱水或不干燥脱水，各分隔室在同一塑料条或板上构成检测卡。 试验时加入待检测的某一种菌液，培养2-48小时，观察鉴定卡上各项反应，按判定表判定试验结果，用此结果编码，查检索表，得到鉴定结果，或将编码输入计算机，用根据数码分类鉴定原理编制的软件鉴定，打印出结果。 鉴定卡上的反应项目 反 应 结 果 代 号 项 目 名 称 阴 性 阳 性 ONPN β-半乳糖苷酶 无色 黄 ADH 精氨酸水解 黄绿 红，橘红 LDC 赖氨酸脱羧 黄绿 红，橘红 ODC 鸟氨酸脱羧 黄绿 红，橘红 CIT 枸椽酸盐利用 黄绿 绿蓝 H2S 产H2S 无色 黑色沉淀 URE 尿素酶 黄 红紫 TDA 色胺酸脱氨酶 黄 红紫 IND 吲哚形成 黄绿 红 VP V.P.试验 无色 红 GEL 蛋白酶 黑粒 黑液 GLU 葡萄糖产酸 蓝 黄绿 MAN 甘露醇产酸 蓝 黄绿 INO 肌醇产酸 蓝 黄绿 SOR 山梨醇产酸 蓝 黄绿 RHA 鼠李糖产酸 蓝 黄绿 SAC 蔗糖产酸 蓝 黄绿 MEL 密二糖产酸 蓝 黄绿 AMY 淀粉产酸 蓝 黄绿 ARA 阿拉伯糖产酸 蓝 黄绿 项目名称 ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RHA SAC MEL AMY ARA 所定数值 1 2 4 1 2 4 1 2 4 1 2 4 1 2 4 1 2 4 1 2 试验结果 + - + + + - - - - + - + + + + + + + + + 记下数值 1 0 4 1 2 0 0 0 0 1 0 4 1 2 4 1 2 4 1 2 编码 5 3 0 5 7 7 3 检索结果 5305773 产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes) API20E举例说明 按鉴定卡上反应项目从左到右的顺序，每三个反应项目编为一组，共编为七组，每组中每个反应项目定为一个数值，依次是1、2、4。试验结果是阳性者记＋，则写下其所定的数值，反应阴性者记－，则写为0，每组中的数值相加，便是该组的编码数，这样便形成了7位数字的编码，查API20E系统的检索表，或输入计算机检索，则能将检验的细菌鉴定出是什么菌种或生物型。 微量多项试验鉴定系统已广泛用于： ◆动、植物检疫 ◆临床检验 ◆食品卫生 ◆药品检查 ◆环境监测 ◆发酵控制 ◆生态研究 尤其是临床检验中深受欢迎，迅猛发展。 国内有河南开封医学生物研究所的肠杆菌科细菌鉴定卡E-15； 上海市卫生防疫站的发酵性革兰氏阴性杆菌鉴定系统SWF-A； 中国人民解放军一八一医院的厌氧菌快速生化鉴定系列ARB-ID； 深圳华士达生物科技有限公司的肠杆菌科的细菌生化鉴定卡ENT等。 国外的产品已标准化、系统化和商品化： 法国生物-梅里埃集团的API/ATB； 瑞士罗氏公司的Micro-ID，Enterotube,Minitek； 美国的Biolog全自动和手动细菌鉴定系统； 日本的微孔滤膜块等； 其中API/ATB包括众多的鉴定系统，共计有750种反应，可鉴定几乎所有常见的细菌； API20E系统主要用来鉴定肠杆菌科细菌。 微量多项鉴测技术优点突出，不仅能快速、敏感、准确、重复性好地鉴检微生物，而且简易，节省人力、物力、时间和空间； 缺点是各系统差异较大，有的价格贵，有的个别反应不准，难判定； 毫无疑问，它是微生物技术方法向快速、简易和自动化发展的重要方向之一。 Enterotube系统是由带有12个分隔室的一根塑料管组成，每个分隔室内装有不同的培养基琼脂斜面，能检验微生物的15种生理生化反应，一根接种丝穿过全部分隔室的各种培养基，并在塑料管的两端突出，被两个塑